RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588494.5

NEDD4L-222, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 4

Gene NEDD4L, Length 505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-222	ENST00000588494	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		0.36	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494		A6NIN4	97 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494		H3BQF6	201 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC00032	P0C843	101 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBE2D3	P61077	147 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	EMX2	Q04743	252 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	WT1-AS	Q06250	92 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	HMGN3	Q15651	99 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	ARL11	Q969Q4	196 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	DSCR8	Q96T75	97 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		0.35	□□□□□ -2.35
NEDD4L-222	ENST00000588494	NPC2	P61916	151 aa		0.34	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	PIGY	Q3MUY2	71 aa		0.34	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		0.34	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	BET1L	Q9NYM9	111 aa		0.34	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		0.34	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		0.34	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		K7ERU9	68 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	PYY	P10082	97 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	RBP2	P50120	134 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	NCS1	P62166	190 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM141	Q96I45	108 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	ERG28	Q9UKR5	140 aa		0.33	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	CCDC179	H3BU77	68 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		J3QLW9	94 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		M0R2P5	195 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPINK1	P00995	79 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	SFTA3	P0C7M3	94 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	MT1L	Q93083	61 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	RERGL	Q9H628	205 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		0.32	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	IGLC1	P0CG04	106 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	S100A3	P33764	101 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	RRAS2	P62070	204 aa	Predicted RBP	0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRCD	Q00LT1	54 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	LINC01545	Q5VT33	79 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	PP6455	Q8WZ26	134 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	COPZ2	Q9P299	210 aa		0.31	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		J3QR89	54 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	COX4I1	P13073	169 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	SELENOW	P63302	87 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		Q0VG73	95 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	SMCO1	Q147U7	214 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	SAR1A	Q9NR31	198 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	CMC2	Q9NRP2	79 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		R4GMQ9	66 aa		0.3	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAV12-3	A0A0B4J271	114 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	RBAKDN	A6NC62	111 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		F2Z2F3	143 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBE2G1	P62253	170 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		Q56UQ5	140 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	CYP2G1P	Q6ZSU1	146 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		Q6ZUT4	128 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	C20orf197	Q8N268	126 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	FAM107B	Q9H098	131 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	RPRM	Q9NS64	109 aa		0.29	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	GNG7	O60262	68 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	CGREF1	Q99674	301 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494	PRR15L	Q9BU68	103 aa		0.28	□□□□□ -2.36
NEDD4L-222	ENST00000588494		A0A087WWC5	75 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	NCR2	O95944	276 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	IL5	P05113	134 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	UBE2D2	P62837	147 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM203	Q969S6	136 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		0.27	□□□□□ -2.37
NEDD4L-222	ENST00000588494	BCE1	O60756	84 aa		0.26	□□□□□ -2.37

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