RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.16□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GX51 115 aa8.15□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 SPRR1BP22528 89 aa8.15□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 Q8NBF4 154 aa8.15□□□□□ -1.1
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.14□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.14□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.14□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.14□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 CLEC2BQ92478 149 aa8.14□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.13□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.11□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 FABP2P12104 132 aa8.11□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.11□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 RNF213Q63HN8 5207 aa8.11□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 H3BQ85 93 aa8.1□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 Q8N377 158 aa8.1□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.1□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
TRAF4-215ENST00000584944 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 SPINK1P00995 79 aa8.07□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 ATXN8Q156A1 80 aa8.07□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 H3BUT2 72 aa8.06□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 TRACP01848 142 aa8.06□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 Q6JHZ5 121 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.05□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 LST1O00453 97 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 SMIM29Q86T20 159 aa8.04□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 C9orf118A6NHY6 69 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 PRR4Q16378 134 aa8.03□□□□□ -1.12
TRAF4-215ENST00000584944 LIMD2Q9BT23 127 aa8.02□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 H3BMG7 143 aa8.01□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 TCL1BO95988 128 aa8□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 CD164Q04900 197 aa8□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 LPAP08519 4548 aa8□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1W2PPM0 123 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 TAX1BP3O14907 124 aa7.99□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GV72 72 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.98□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.97□□□□□ -1.13
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.96□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 A0A0G2JQZ4 141 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 UBE2V1Q13404 147 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 IGFL1Q6UW32 110 aa7.95□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 C9JAW5 83 aa7.94□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.94□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 DSCR8Q96T75 97 aa7.93□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.91□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 TEN1Q86WV5 123 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAF4-215ENST00000584944 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.89□□□□□ -1.15
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TRAF4-215ENST00000584944 CCKP06307 115 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAF4-215ENST00000584944 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAF4-215ENST00000584944 H3BT86 120 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAF4-215ENST00000584944 Q5XG85 94 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAF4-215ENST00000584944 Q6Q795 121 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAF4-215ENST00000584944 MTURNQ8N3F0 131 aa7.84□□□□□ -1.15
TRAF4-215ENST00000584944 CDIP1Q9H305 208 aa7.84□□□□□ -1.15
TRAF4-215ENST00000584944 A0A087WSZ3 146 aa7.83□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.83□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 K7EP34 96 aa7.83□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 PDE6GP18545 87 aa7.83□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.81□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1W2PNM2 257 aa7.8□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.8□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 TPRXLQ17RH7 258 aa7.79□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 C1orf195Q5TG92 126 aa7.79□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.78□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 MUC2Q02817 5179 aa7.78□□□□□ -1.16
TRAF4-215ENST00000584944 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.77□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZQT0 140 aa7.74□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 SIGMAR1Q99720 223 aa7.74□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 A0A1B0GW54 56 aa7.73□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 F8W1H4 67 aa7.73□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 C9orf92A6NGG3 77 aa7.72□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.72□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.72□□□□□ -1.17
TRAF4-215ENST00000584944 IGKV4-1P06312 121 aa7.7□□□□□ -1.18
TRAF4-215ENST00000584944 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TRAF4-215ENST00000584944 NREPQ16612 68 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAF4-215ENST00000584944 PRO0461Q9UI25 63 aa7.67□□□□□ -1.18
TRAF4-215ENST00000584944 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAF4-215ENST00000584944 A0A0U1RQV1 116 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAF4-215ENST00000584944 J3KT08 172 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAF4-215ENST00000584944 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.63□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 NDUFB1O75438 58 aa7.63□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 ETDBQ3ZM63 59 aa7.63□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 Q96NJ1 140 aa7.63□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 MUC17Q685J3 4493 aa7.63□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.62□□□□□ -1.19
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