RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6ZVQ6	151 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.68	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	NPC2	P61916	151 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.67	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	COLCA2	A8K830	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932		H0Y8G0	127 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLN	P26678	52 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP10-10	P60014	251 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q1RN00	199 aa		4.66	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A0J9YXY3	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	HSBP1	O75506	76 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	AKR1D1	P51857	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRGC2	P03986	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	HERVK_113	P61574	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	DPM2	O94777	84 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	TCL1B	O95988	128 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	TAL2	Q16559	108 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	COX7B	P24311	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGKC	P01834	107 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932		E9PLD3	99 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	SERF1A	O75920	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	TIMM17B	O60830	172 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A1B0GWB2	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	FABP4	P15090	132 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.54	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932		A8MUU9	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	S100A1	P23297	94 aa		4.53	□□□□□ -1.68
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q96NJ1	140 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.52	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.51	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932		F8WEM9	126 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.5	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932		A6NDN8	102 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6JHZ5	121 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.49	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	IFITM1	P13164	125 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.46	□□□□□ -1.69
TOM1L1-223	ENST00000576932	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	HRES1	P13985	223 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.46	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	DSCR10	P59022	87 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6ZQY7	126 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6ZVH6	145 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.45	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932		A8MWP4	228 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	LST1	O00453	97 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTDAP	P60985	99 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.44	□□□□□ -1.7

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