RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 SPAG11BQ08648 103 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 ZNF345Q14585 488 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C7orf65Q6ZTY9 151 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 Q86TA4 180 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 PRELID3AQ96N28 172 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TP53RKQ96S44 253 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 GGACTQ9BVM4 153 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 SPANXA1Q9NS26 97 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TMEM242Q9NWH2 141 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 NDUFB11Q9NX14 153 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.63□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C9orf170A2RU37 121 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 FAM25AB3EWG3 89 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 FAM25CB3EWG5 89 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 FAM25GB3EWG6 89 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 EDF1O60869 148 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 FXYD2P54710 66 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 RPS28P62857 69 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 PDE6HQ13956 83 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 NDUFA5Q16718 116 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 CLLU1Q5K131 121 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 CLEC2BQ92478 149 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 RAB37Q96AX2 223 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 CST9LQ9H4G1 147 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 SCN3BQ9NY72 215 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 CACFD1Q9UGQ2 172 aa0.62□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 H0YAA0 97 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 J3QR89 54 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 DLEU1O43261 78 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 METTL15P1P0C7V9 234 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 IGLC6P0CF74 106 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TPT1P13693 172 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 FABP4P15090 132 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 ROMO1P60602 79 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 NCS1P62166 190 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 SPANXN5Q5MJ07 72 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 Q9BRP9 147 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 ERG28Q9UKR5 140 aa0.61□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 hDV103S1A0JD37 113 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 EFCAB10A6NFE3 127 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 ZNF727A8MUV8 499 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 F6UZH7 168 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 LYRM1O43325 122 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 HBDP02042 147 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 MT1EP04732 61 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 AKR1D1P51857 326 aa0.6□□□□□ -2.31
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RRN3-204ENST00000561685 ZNF56Q15929 161 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 MT1MQ8N339 61 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TMEM254Q8TBM7 123 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 HYLS1Q96M11 299 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 FXYD6Q9H0Q3 95 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C14orf132Q9NPU4 83 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 SPANXCQ9NY87 97 aa0.6□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
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RRN3-204ENST00000561685 C17orf112F2Z3M2 114 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 H3BVH4 76 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 GNGT2O14610 69 aa0.59□□□□□ -2.31
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RRN3-204ENST00000561685 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 MIC13Q5XKP0 118 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TEX261Q6UWH6 196 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TMEM91Q6ZNR0 172 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C5orf38Q86SI9 138 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 SFT2D1Q8WV19 159 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 TMEM14CQ9P0S9 112 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0.59□□□□□ -2.31
RRN3-204ENST00000561685 F8W036 122 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 DNAL4O96015 105 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 ARMS2P0C7Q2 107 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 IL7P13232 177 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 MIR22HGQ0VDD5 57 aa0.58□□□□□ -2.32
RRN3-204ENST00000561685 S100A7L2Q5SY68 101 aa0.58□□□□□ -2.32
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