RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 SPATA45Q537H7 98 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-217ENST00000550044 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-217ENST00000550044 COX7BP24311 80 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 HIST1H4GQ99525 98 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 VAMP8Q9BV40 100 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 LINC00483Q53H64 154 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 DLEU1O43261 78 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 PYY3Q5JQD4 70 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 Q8NBF4 154 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 C12orf57Q99622 126 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 MOBPQ13875 183 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GWB2 263 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 TAL2Q16559 108 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-217ENST00000550044 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 HIGD1BQ9P298 99 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 MUC17Q685J3 4493 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 VAMP3Q15836 100 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 H7C2G1 150 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 CFC1BP0CG36 223 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 CFC1P0CG37 223 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 SPRR1BP22528 89 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 Q1RN00 199 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 SLC25A20O43772 301 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 SPINK1P00995 79 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 CTAG1AP78358 180 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 LINC00575Q6W349 94 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 CEND1Q8N111 149 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 RAB37Q96AX2 223 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CS-217ENST00000550044 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 hADV29S1A0JD25 119 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 SMIM29Q86T20 159 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 Q8N377 158 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 A0A0B4J2C4 111 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 FXYD2P54710 66 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 MTURNQ8N3F0 131 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JQZ4 141 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 Q6ZQY7 126 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 PRO1933Q9H354 126 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 HSD52Q0P140 79 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 H0YGX0 51 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 K7ERJ3 54 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 PRAC1Q96KF2 57 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-217ENST00000550044 TPRXLQ17RH7 258 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 F8WEM9 126 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 SNCGO76070 127 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 SNHG12Q9BXW3 62 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 PSMB2P49721 201 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 CD164Q04900 197 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 OCIAD2Q56VL3 154 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 LIMD2Q9BT23 127 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 CLEC2BQ92478 149 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 H3BUT2 72 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 SMIM6P0DI80 62 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 IGFL1Q6UW32 110 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.34□□□□□ -1.55
CS-217ENST00000550044 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 A0A1B0GX51 115 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 COX6CP09669 75 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 FABP2P12104 132 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 Q6JHZ5 121 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 C1orf195Q5TG92 126 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 Q5XG85 94 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 C9orf92A6NGG3 77 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 H3BMG7 143 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 TCL1BO95988 128 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 DNAL4O96015 105 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-217ENST00000550044 M0R143 59 aa5.29□□□□□ -1.56
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