RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542447.6

CADM1-212, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CADM1, Length 4,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-212ENST00000542447 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.52□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 PRR34Q9NV39 138 aa7.52□□□□□ -1.21
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CADM1-212ENST00000542447 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.49□□□□□ -1.21
CADM1-212ENST00000542447 CASC10Q5T4H9 136 aa7.48□□□□□ -1.21
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CADM1-212ENST00000542447 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.22□□□□□ -1.25
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CADM1-212ENST00000542447 C14orf177Q52M58 125 aa7.22□□□□□ -1.25
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CADM1-212ENST00000542447 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.19□□□□□ -1.26
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CADM1-212ENST00000542447 HRES1P13985 223 aa7.17□□□□□ -1.26
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CADM1-212ENST00000542447 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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CADM1-212ENST00000542447 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.13□□□□□ -1.27
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CADM1-212ENST00000542447 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CADM1-212ENST00000542447 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.11□□□□□ -1.27
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CADM1-212ENST00000542447 UQCR11O14957 56 aa7.08□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.07□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.07□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.06□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 A0A087X002 238 aa7.06□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.06□□□□□ -1.28
CADM1-212ENST00000542447 COL7A1Q02388 2944 aa7.06□□□□□ -1.28
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