RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 MT1HP80294 61 aa6.35□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.34□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 A4D1N5 150 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 COPS9Q8WXC6 57 aa6.33□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 COX8AP10176 69 aa6.32□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 TSTD3H0UI37 97 aa6.31□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 DLEU1O43261 78 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.3□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00575Q6W349 94 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 C14orf144Q96I85 54 aa6.29□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CLSTN3-211ENST00000541667 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.26□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 HIGD1BQ9P298 99 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.25□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 hADV29S1A0JD25 119 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 VAMP3Q15836 100 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 IGFL1Q6UW32 110 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZQY7 126 aa6.24□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 TCL1BO95988 128 aa6.23□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.22□□□□□ -1.41
CLSTN3-211ENST00000541667 CFC1BP0CG36 223 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 HSD52Q0P140 79 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6JHZ5 121 aa6.21□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 CLEC2BQ92478 149 aa6.2□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 F8WEM9 126 aa6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 HIST1H4GQ99525 98 aa6.18□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R143 59 aa6.17□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 CFC1P0CG37 223 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 CEND1Q8N111 149 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.16□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 A6NJY4 79 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BUT2 72 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 Q75L30 129 aa6.15□□□□□ -1.42
CLSTN3-211ENST00000541667 FXYD2P54710 66 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.14□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.13□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6Q795 121 aa6.12□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.11□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0B4J2C4 111 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 M0R2T5 61 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 LST1O00453 97 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 BATFQ16520 125 aa6.1□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 H0YGX0 51 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 Q96NJ1 140 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.09□□□□□ -1.43
CLSTN3-211ENST00000541667 TEN1Q86WV5 123 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 A8MUU9 505 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 K7ERJ3 54 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 RAB37Q96AX2 223 aa6.06□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PNM2 257 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.05□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087WSZ3 146 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.04□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GX51 115 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BMG7 143 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.03□□□□□ -1.44
CLSTN3-211ENST00000541667 TAX1BP3O14907 124 aa6.01□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIAP1O43715 76 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 SNCGO76070 127 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 DSCR10P59022 87 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 USH2AO75445 5202 aa6□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 FABP2P12104 132 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.99□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 SSPOA2VEC9 5147 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf118A6NHY6 69 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.98□□□□□ -1.45
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.96□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.96□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1W2PPM0 123 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 GHRHP01286 108 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 PSMB2P49721 201 aa5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 COX6CP09669 75 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00313P59037 77 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.94□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV4-1P06312 121 aa5.93□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.92□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 HRES1P13985 223 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 SIGMAR1Q99720 223 aa5.91□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GV72 72 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.9□□□□□ -1.46
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