RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538933.1

CLSTN3-208, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-208ENST00000538933 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.44□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 TCL1BO95988 128 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.43□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 LST1O00453 97 aa7.42□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 ERC2-IT1O76042 136 aa7.42□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 GHRHP01286 108 aa7.42□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 Q6ZQY7 126 aa7.42□□□□□ -1.22
CLSTN3-208ENST00000538933 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.42□□□□□ -1.22
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CLSTN3-208ENST00000538933 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.4□□□□□ -1.22
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CLSTN3-208ENST00000538933 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.38□□□□□ -1.23
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CLSTN3-208ENST00000538933 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.35□□□□□ -1.23
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CLSTN3-208ENST00000538933 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.33□□□□□ -1.24
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CLSTN3-208ENST00000538933 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLSTN3-208ENST00000538933 LINC00483Q53H64 154 aa7.31□□□□□ -1.24
CLSTN3-208ENST00000538933 H3BT86 120 aa7.3□□□□□ -1.24
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CLSTN3-208ENST00000538933 TEN1Q86WV5 123 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-208ENST00000538933 CDIP1Q9H305 208 aa7.16□□□□□ -1.26
CLSTN3-208ENST00000538933 A0A0G2JQZ4 141 aa7.15□□□□□ -1.26
CLSTN3-208ENST00000538933 CCKP06307 115 aa7.14□□□□□ -1.27
CLSTN3-208ENST00000538933 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.14□□□□□ -1.27
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CLSTN3-208ENST00000538933 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.13□□□□□ -1.27
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CLSTN3-208ENST00000538933 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.07□□□□□ -1.28
CLSTN3-208ENST00000538933 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CLSTN3-208ENST00000538933 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.05□□□□□ -1.28
CLSTN3-208ENST00000538933 A0A1B0GW54 56 aa7.04□□□□□ -1.28
CLSTN3-208ENST00000538933 J3QR89 54 aa7.03□□□□□ -1.28
CLSTN3-208ENST00000538933 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CLSTN3-208ENST00000538933 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7□□□□□ -1.29
CLSTN3-208ENST00000538933 NREPQ16612 68 aa6.99□□□□□ -1.29
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