RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		7.03	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	FXYD2	P54710	66 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		7.02	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0U1RQV1	116 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	BATF	Q16520	125 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.01	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0G2JQZ4	141 aa		7	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFC1B	P0CG36	223 aa		7	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CFC1	P0CG37	223 aa		7	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	CD164	Q04900	197 aa		7	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	XP32	Q5T750	250 aa		7	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0B4J2C4	111 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00575	Q6W349	94 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	LIMD2	Q9BT23	127 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		6.98	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q5XG85	94 aa		6.97	□□□□□ -1.29
SH3BP2-222	ENST00000512014		H7C2G1	150 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014		K7ERJ3	54 aa		6.96	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	6.94	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		6.94	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf195	Q5TG92	126 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZQY7	126 aa		6.93	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	hADV29S1	A0JD25	119 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	VAMP3	Q15836	100 aa		6.92	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf92	A6NGG3	77 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	PSMB2	P49721	201 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		6.91	□□□□□ -1.3
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX6C	P09669	75 aa		6.88	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	6.88	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGFL1	Q6UW32	110 aa		6.87	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAX1BP3	O14907	124 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRIAP1	O43715	76 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		6.86	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf118	A6NHY6	69 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8WEM9	126 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		H0YGX0	51 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BUT2	72 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCOTH	Q58A44	107 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCE2C	Q5TA81	110 aa		6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	6.85	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6JHZ5	121 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	CLEC2B	Q92478	149 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.84	□□□□□ -1.31
SH3BP2-222	ENST00000512014	SNCG	O76070	127 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		6.83	□□□□□ -1.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	TCL1B	O95988	128 aa		6.82	□□□□□ -1.32
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PPM0	123 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	FABP2	P12104	132 aa		6.8	□□□□□ -1.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	6.79	□□□□□ -1.32
SH3BP2-222	ENST00000512014	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	6.77	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATXN8	Q156A1	80 aa		6.77	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GX51	115 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6Q795	121 aa		6.76	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	LST1	O00453	97 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	DNAL4	O96015	105 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	6.75	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAC	P01848	142 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	MT1H	P80294	61 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GHRH	P01286	108 aa		6.72	□□□□□ -1.33
SH3BP2-222	ENST00000512014	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEN1	Q86WV5	123 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q96NJ1	140 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		6.71	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BMG7	143 aa		6.7	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		K7EP34	96 aa		6.7	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		6.7	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1W2PNM2	257 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		C9JAW5	83 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BQ85	93 aa		6.69	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A087WSZ3	146 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q75L30	129 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GV90	55 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014		H3BT86	120 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	MTURN	Q8N3F0	131 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GV72	72 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBE2V1	Q13404	147 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014		A8MUU9	505 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8W1H4	67 aa		6.6	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	DSCR10	P59022	87 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRO0461	Q9UI25	63 aa		6.59	□□□□□ -1.35

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