RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXC	Q9NY87	97 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.58	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	C6orf99	Q4VX62	202 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.58	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YXY3	114 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	DPM2	O94777	84 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LITAF	Q99732	161 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		5.57	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	IGKC	P01834	107 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	5.54	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511		F8WEM9	126 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00846	Q9NV44	126 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.52	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GWB2	263 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP4	P15090	132 aa		5.51	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	MT2A	P02795	61 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511		Q96NJ1	140 aa		5.5	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511		E9PLD3	99 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-10	P60014	251 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511		A6NDN8	102 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMM17B	O60830	172 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	APOC3	P02656	99 aa		5.48	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	SERF1A	O75920	110 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2V1	Q13404	147 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SKAP2-209	ENST00000497511		A4D1N5	150 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF815P	A8K554	130 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SNAPIN	O95295	136 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA5	Q16718	116 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	MT1F	P04733	61 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFL1	Q6UW32	110 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6JHZ5	121 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SVBP	Q8N300	66 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC2B	Q92478	149 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	LST1	O00453	97 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	COPS9	Q8WXC6	57 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		5.43	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TRGC2	P03986	189 aa		5.41	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-5	P60370	271 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5.4	□□□□□ -1.54
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MUU9	505 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	VAMP3	Q15836	100 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	YPEL4	Q96NS1	127 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE1F	Q5T754	118 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZQY7	126 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.38	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	IFITM1	P13164	125 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.37	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		5.35	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFAF8	A1L188	74 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	DSCR10	P59022	87 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00575	Q6W349	94 aa		5.34	□□□□□ -1.55
SKAP2-209	ENST00000497511	NEB	P20929	6669 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511		H3BUT2	72 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZVH6	145 aa		5.33	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	MTURN	Q8N3F0	131 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGMAR1	Q99720	223 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	HRES1	P13985	223 aa		5.29	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A087WSZ3	146 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00313	P59037	77 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTDAP	P60985	99 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	C12orf57	Q99622	126 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	COLCA2	A8K830	154 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MWP4	228 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		5.23	□□□□□ -1.57
SKAP2-209	ENST00000497511	SNCG	O76070	127 aa		5.22	□□□□□ -1.57

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