RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 RYR1P21817 5038 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 NWD1Q149M9 1564 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 RYR2Q92736 4967 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 GNG13Q9P2W3 67 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.02□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.03□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 ATXN8Q156A1 80 aa-0.03□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.03□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-0.03□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.03□□□□□ -2.41
SSB-211ENST00000490914 AKAP13Q12802 2813 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 HERC2O95714 4834 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 H0YAA0 97 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 COL6A3P12111 3177 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DIP2BQ9P265 1576 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.04□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.05□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 H3BNG1 76 aa-0.05□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 IAPPP10997 89 aa-0.05□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.05□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.05□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.06□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.06□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 CRIP1P50238 77 aa-0.06□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.06□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.06□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 PDZD2O15018 2839 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 SPTBN4Q9H254 2564 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 SPRR2AP35326 72 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 PRLHP81277 87 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 NESP48681 1621 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.07□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 ABCA13Q86UQ4 5058 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DEPDC5O75140 1603 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 C4AP0C0L4 1744 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 C4BP0C0L5 1744 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 TGP01266 2768 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 NF1P21359 2839 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 WIZO95785 1651 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 SCRIBQ14160 1630 aa-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 MTORP42345 2549 aa-0.1□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 PLXNC1O60486 1568 aa-0.1□□□□□ -2.42
SSB-211ENST00000490914 HTTP42858 3142 aa-0.1□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.1□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 KALRNO60229 2985 aa-0.1□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 TRIOO75962 3097 aa-0.1□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 TACC2O95359 2948 aa-0.1□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa-0.11□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 SPRR2EP22531 72 aa-0.11□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.11□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.11□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.11□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.11□□□□□ -2.43
SSB-211ENST00000490914 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
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