RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 MT1FP04733 61 aa6.77□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.77□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.76□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM236CP0DP71 79 aa6.76□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 IFITM1P13164 125 aa6.76□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP10-10P60014 251 aa6.76□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.76□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.75□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.75□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC01545Q5VT33 79 aa6.75□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.75□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 A8MUU9 505 aa6.74□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 VAMP3Q15836 100 aa6.74□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZQY7 126 aa6.74□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.74□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 PET117Q6UWS5 81 aa6.73□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00846Q9NV44 126 aa6.73□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00575Q6W349 94 aa6.72□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZVH6 145 aa6.72□□□□□ -1.33
SDCCAG3-210ENST00000481114 hADV29S1A0JD25 119 aa6.71□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.69□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.68□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.67□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.67□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 H3BUT2 72 aa6.66□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 COLCA2A8K830 154 aa6.65□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 SCGB1D1O95968 90 aa6.65□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 C3orf79P0CE67 100 aa6.65□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.65□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
SDCCAG3-210ENST00000481114 DSCR10P59022 87 aa6.64□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.64□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.64□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.63□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTDAPP60985 99 aa6.63□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BKO60814 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BJP06899 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HRES1P13985 223 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BOP23527 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BBP33778 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BDP58876 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BCP62807 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.61□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 TEN1Q86WV5 123 aa6.6□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A087WSZ3 146 aa6.59□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 ATOH7Q8N100 152 aa6.59□□□□□ -1.35
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.58□□□□□ -1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00313P59037 77 aa6.57□□□□□ -1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 SIGMAR1Q99720 223 aa6.57□□□□□ -1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.56□□□□□ -1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.55□□□□□ -1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 C12orf57Q99622 126 aa6.55□□□□□ -1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 MTURNQ8N3F0 131 aa6.54□□□□□ -1.36
SDCCAG3-210ENST00000481114 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 SNCGO76070 127 aa6.5□□□□□ -1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGKV4-1P06312 121 aa6.5□□□□□ -1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 H3BMG7 143 aa6.48□□□□□ -1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 A8MWP4 228 aa6.47□□□□□ -1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1W2PNM2 257 aa6.46□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.44□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 H0YGX0 51 aa6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 FABP2P12104 132 aa6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H4GQ99525 98 aa6.43□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 GHRHP01286 108 aa6.42□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.41□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPINK7P58062 85 aa6.41□□□□□ -1.38
SDCCAG3-210ENST00000481114 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.39□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 RAB37Q96AX2 223 aa6.39□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 NEBP20929 6669 aa6.39□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.38□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 S100A6P06703 90 aa6.38□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.38□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 C8orf87E5RJ46 101 aa6.36□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1B0GV72 72 aa6.35□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1B0GX51 115 aa6.35□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A1B0GVX0 72 aa6.34□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.34□□□□□ -1.39
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRACP01848 142 aa6.33□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A0B4J2C4 111 aa6.32□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 CCKP06307 115 aa6.32□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.3□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 COX8AP10176 69 aa6.29□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 S100A2P29034 98 aa6.29□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.28□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.28□□□□□ -1.4
SDCCAG3-210ENST00000481114 DNAL4O96015 105 aa6.27□□□□□ -1.41
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