RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476227.1

TTC21B-204, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 21B, humanhuman

TSL 3

Gene TTC21B, Length 651 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC21B-204ENST00000476227 LTN1O94822 1766 aa-1.58□□□□□ -2.66
TTC21B-204ENST00000476227 ATP7BP35670 1465 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 H0YAA0 97 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 K7EP34 96 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 DEFB1P60022 68 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 NWD1Q149M9 1564 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 UBR1Q8IWV7 1749 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 DOT1LQ8TEK3 1739 aa-1.6□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 WIZO95785 1651 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 CEP290O15078 2479 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 PLGLAQ15195 96 aa-1.61□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-1.61□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 FANCAO15360 1455 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 FRYQ5TBA9 3013 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 WFDC9Q8NEX5 89 aa-1.62□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 TRAV21A0A0B4J279 112 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 LINC00032P0C843 101 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 DEPDC5O75140 1603 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.63□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-1.64□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 C5orf42Q9H799 3197 aa-1.64□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-1.65□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 CYB5AP00167 134 aa-1.65□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 DPY30Q9C005 99 aa-1.65□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 COL12A1Q99715 3063 aa-1.65□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 ATP10BO94823 1461 aa-1.65□□□□□ -2.67
TTC21B-204ENST00000476227 DEFB106AQ8N104 65 aa-1.66□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 DEFB130BP0DP73 79 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 PEA15Q15121 130 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 C14orf144Q96I85 54 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-1.67□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.68□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 CNTLNQ9NXG0 1405 aa-1.68□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 IAPPP10997 89 aa-1.69□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 SMIM11AP58511 58 aa-1.69□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.7□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.7□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.7□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 IFI6P09912 130 aa-1.7□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa-1.7□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 LCE6AA0A183 80 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 ACYP1P07311 99 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 S100PP25815 95 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.71□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 BPTFQ12830 3046 aa-1.72□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.72□□□□□ -2.68
TTC21B-204ENST00000476227 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.73□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 NCMAPQ5T1S8 102 aa-1.73□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 TCEAL7Q9BRU2 100 aa-1.73□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-1.73□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 NCOA2Q15596 1464 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 AKAP12Q02952 1782 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 RBP2P50120 134 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 MT1XP80297 61 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.74□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 CHD7Q9P2D1 2997 aa-1.75□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 NDUFB1O75438 58 aa-1.75□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.75□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 CEP162Q5TB80 1403 aa-1.75□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-1.76□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 GYPAP02724 150 aa-1.76□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 ITSN1Q15811 1721 aa-1.77□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-1.77□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-1.77□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-1.77□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-1.78□□□□□ -2.69
TTC21B-204ENST00000476227 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.79□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 ITPR1Q14643 2758 aa-1.79□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-1.8□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP-1.8□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-1.8□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 M0R143 59 aa-1.8□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.8□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-1.8□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.8□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 NDUFA4O00483 81 aa-1.81□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.81□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-1.82□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.82□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-1.83□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-1.83□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-1.83□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 LRBAP50851 2863 aa-1.83□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 SNHG12Q9BXW3 62 aa-1.83□□□□□ -2.7
TTC21B-204ENST00000476227 RICTORQ6R327 1708 aa-1.83□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 539.7 ms