RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449305.5

CCDC18-AS1-217, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC18-AS1, Length 748 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SMIM29Q86T20 159 aa9.15□□□□□ -0.94
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.15□□□□□ -0.94
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A1B0GV72 72 aa9.13□□□□□ -0.95
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.11□□□□□ -0.95
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.08□□□□□ -0.96
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.05□□□□□ -0.96
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q6JHZ5 121 aa9.05□□□□□ -0.96
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9□□□□□ -0.97
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A087X002 238 aa8.99□□□□□ -0.97
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 VPS25Q9BRG1 176 aa8.99□□□□□ -0.97
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A0G2JQZ4 141 aa8.96□□□□□ -0.98
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A1W2PNM2 257 aa8.96□□□□□ -0.98
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ACYP1P07311 99 aa8.96□□□□□ -0.98
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A0A1B0GW54 56 aa8.95□□□□□ -0.98
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q6Q795 121 aa8.95□□□□□ -0.98
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.94□□□□□ -0.98
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CD164Q04900 197 aa8.9□□□□□ -0.98
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.88□□□□□ -0.99
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.83□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.83□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa8.83□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.83□□□□□ -1
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CDIP1Q9H305 208 aa8.82□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP10-8P60410 259 aa8.81□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SPINK1P00995 79 aa8.8□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.79□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 OXTP01178 125 aa8.79□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LIMD2Q9BT23 127 aa8.79□□□□□ -1
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00643Q86TS7 51 aa8.78□□□□□ -1
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CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.75□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 BPY2O14599 106 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT1HL1P0DM35 61 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 CXCL6P80162 114 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 SIGMAR1Q99720 223 aa8.71□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 J3KT08 172 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 Q96NJ1 140 aa8.7□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.69□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MT-ATP8P03928 68 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IGKV4-1P06312 121 aa8.67□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 C1orf195Q5TG92 126 aa8.66□□□□□ -1.02
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 DSCR10P59022 87 aa8.64□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 TNXBP22105 4242 aa8.62□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 A8MWP4 228 aa8.61□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 NDUFB1O75438 58 aa8.61□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 IMUPQ9GZP8 106 aa8.61□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 MYCBP2O75592 4640 aa8.59□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 J3QL48 77 aa8.59□□□□□ -1.03
CCDC18-AS1-217ENST00000449305 K7EQZ3 153 aa8.59□□□□□ -1.03
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