RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.74□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GVY2 172 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1B0GW54 56 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 UQCRQO14949 82 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6JHZ5 121 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00846Q9NV44 126 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP10-1P60331 282 aa5.71□□□□□ -1.49
CCNDBP1-202ENST00000444658 RYR2Q92736 4967 aa5.71□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8N377 158 aa5.71□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.71□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.71□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.71□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.71□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPRR1BP22528 89 aa5.7□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBL5Q9BZL1 73 aa5.7□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.7□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 ERC2-IT1O76042 136 aa5.69□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE2AP49459 152 aa5.69□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATOX1O00244 68 aa5.68□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF861PO60384 105 aa5.68□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.68□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRLHP81277 87 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCXQ7RTU7 201 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.67□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.66□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 J3KT08 172 aa5.66□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 COX7CP15954 63 aa5.66□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.66□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.65□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 CRYGAP11844 174 aa5.65□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 C1orf137Q5JT78 98 aa5.65□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.65□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.65□□□□□ -1.5
CCNDBP1-202ENST00000444658 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV7-43P04211 117 aa5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM29Q86T20 159 aa5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 CXCL6P80162 114 aa5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00483Q53H64 154 aa5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5orf47Q569G3 176 aa5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZVQ6 151 aa5.63□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.63□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 PKHD1P08F94 4074 aa5.62□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 F8WEM9 126 aa5.62□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 TMEM258P61165 79 aa5.62□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPRR4Q96PI1 79 aa5.62□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.6□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q8NBF4 154 aa5.6□□□□□ -1.51
CCNDBP1-202ENST00000444658 LCE3BQ5TA77 95 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERP2Q8N6R1 65 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A1W2PNM2 257 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 HAMPP81172 84 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 NREPQ16612 68 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 RYR3Q15413 4870 aa5.57□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.55□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.55□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 CDK2AP2O75956 126 aa5.54□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGFL1Q6UW32 110 aa5.54□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.54□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087WVE0 104 aa5.52□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 BPY2O14599 106 aa5.52□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 CD164Q04900 197 aa5.51□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGKV4-1P06312 121 aa5.48□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.48□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.48□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAT1Q14517 4588 aa5.48□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.47□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.46□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.46□□□□□ -1.53
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087WSZ3 146 aa5.45□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 MOBPQ13875 183 aa5.45□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 DSCR10P59022 87 aa5.45□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSPG2P98160 4391 aa5.44□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q5XG85 94 aa5.44□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.44□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087X002 238 aa5.43□□□□□ -1.54
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A0G2JQZ4 141 aa5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.4 ms