RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM254Q8TBM7 123 aa10□□□□□ -0.81
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SHQ1-202ENST00000444040 H0Y9J4 135 aa9.97□□□□□ -0.81
SHQ1-202ENST00000444040 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
SHQ1-202ENST00000444040 EPM2AB3EWF7 344 aa9.97□□□□□ -0.81
SHQ1-202ENST00000444040 K7EQZ3 153 aa9.96□□□□□ -0.81
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SHQ1-202ENST00000444040 A0A087WSZ3 146 aa9.91□□□□□ -0.82
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SHQ1-202ENST00000444040 SMIM26A0A096LP01 95 aa9.74□□□□□ -0.85
SHQ1-202ENST00000444040 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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SHQ1-202ENST00000444040 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.69□□□□□ -0.86
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SHQ1-202ENST00000444040 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.63□□□□□ -0.87
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF861PO60384 105 aa9.62□□□□□ -0.87
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SHQ1-202ENST00000444040 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.59□□□□□ -0.87
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SHQ1-202ENST00000444040 H3BPC8 53 aa9.58□□□□□ -0.88
SHQ1-202ENST00000444040 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.58□□□□□ -0.88
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SHQ1-202ENST00000444040 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.52□□□□□ -0.89
SHQ1-202ENST00000444040 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.52□□□□□ -0.89
SHQ1-202ENST00000444040 LY6G6CO95867 125 aa9.51□□□□□ -0.89
SHQ1-202ENST00000444040 TGP01266 2768 aa9.5□□□□□ -0.89
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1B0GVX0 72 aa9.5□□□□□ -0.89
SHQ1-202ENST00000444040 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.5□□□□□ -0.89
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SHQ1-202ENST00000444040 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.44□□□□□ -0.9
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SHQ1-202ENST00000444040 Q1T7F1 81 aa9.43□□□□□ -0.9
SHQ1-202ENST00000444040 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.43□□□□□ -0.9
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