RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429968.5

RBM39-212, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 2,149 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-212ENST00000429968 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.81□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.81□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 REG3GQ6UW15 175 aa8.8□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.8□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.79□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.78□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 UBE2BP63146 152 aa8.78□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 PRLHP81277 87 aa8.78□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 C3orf84H3BNL1 204 aa8.78□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 PANO1I0J062 215 aa8.78□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 Q75L30 129 aa8.78□□□□□ -1
RBM39-212ENST00000429968 NDUFS5O43920 106 aa8.77□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.77□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.77□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 A0A0G2JQZ4 141 aa8.76□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 NUPR2A6NF83 97 aa8.76□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 FBN3Q75N90 2809 aa8.75□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 A0A1W2PNM2 257 aa8.75□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 SMIM29Q86T20 159 aa8.75□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 Q8N9L7 120 aa8.74□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 BCE1O60756 84 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 CXCL6P80162 114 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 TGP01266 2768 aa8.73□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.72□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 C1orf137Q5JT78 98 aa8.71□□□□□ -1.01
RBM39-212ENST00000429968 C14orf177Q52M58 125 aa8.71□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 A8MUN3 132 aa8.7□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.7□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 BPY2O14599 106 aa8.69□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.68□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 H0Y9J4 135 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 NREPQ16612 68 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.67□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 IGKV4-1P06312 121 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 Q8NBF4 154 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.66□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 LCA10Q71F78 164 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 C20orf197Q8N268 126 aa8.65□□□□□ -1.02
RBM39-212ENST00000429968 IGFL1Q6UW32 110 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 SPRR4Q96PI1 79 aa8.64□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 A0A087WTM6 91 aa8.63□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 Q6ZR54 194 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 MP68P56378 58 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 KLKP1Q107X0 134 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 H7BZZ5 65 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 LINC00313P59037 77 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-212ENST00000429968 DSCR10P59022 87 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.57□□□□□ -1.04
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RBM39-212ENST00000429968 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 RTL8CO15255 209 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.55□□□□□ -1.04
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RBM39-212ENST00000429968 K7EQZ3 153 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 SPRR1BP22528 89 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 SNURFQ9Y675 71 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 A0A087WSZ3 146 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-212ENST00000429968 OCR1Q9BZK8 76 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-212ENST00000429968 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-212ENST00000429968 LY6G6CO95867 125 aa8.49□□□□□ -1.05
RBM39-212ENST00000429968 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-212ENST00000429968 PKD1P98161 4303 aa8.48□□□□□ -1.05
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RBM39-212ENST00000429968 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.48□□□□□ -1.05
RBM39-212ENST00000429968 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.47□□□□□ -1.05
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RBM39-212ENST00000429968 PSPHP1O15172 72 aa8.45□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.44□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.44□□□□□ -1.06
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RBM39-212ENST00000429968 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.43□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 LINC01554Q52M75 96 aa8.42□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.41□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 LINC00483Q53H64 154 aa8.4□□□□□ -1.06
RBM39-212ENST00000429968 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
RBM39-212ENST00000429968 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-212ENST00000429968 HCG22E2RYF7 251 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-212ENST00000429968 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-212ENST00000429968 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.39□□□□□ -1.07
RBM39-212ENST00000429968 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.39□□□□□ -1.07
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