RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405655.7

PRAME-205, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-205ENST00000405655 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 H3BQ85 93 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 SCXQ7RTU7 201 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 UQCRQO14949 82 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.67□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 UBE2AP49459 152 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 GHRHP01286 108 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 A0A1W2PNM2 257 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 Q6ZVQ6 151 aa8.65□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 Q6JHZ5 121 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 C1orf137Q5JT78 98 aa8.63□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 BCE1O60756 84 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 UBL5Q9BZL1 73 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP10-1P60331 282 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 COX7CP15954 63 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 CRYGAP11844 174 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 Q8N9L7 120 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-205ENST00000405655 PDE6GP18545 87 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 IGFL1Q6UW32 110 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.58□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.57□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 H0Y9J4 135 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 F8WEM9 126 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 Q8NBF4 154 aa8.54□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 ATOX1O00244 68 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 RYR2Q92736 4967 aa8.52□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 BPY2O14599 106 aa8.52□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 TMEM258P61165 79 aa8.52□□□□□ -1.04
PRAME-205ENST00000405655 NREPQ16612 68 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 SPRR4Q96PI1 79 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 OXTP01178 125 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 SPRR1BP22528 89 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 A0A087WSZ3 146 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 Q5XG85 94 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.46□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 ZNF861PO60384 105 aa8.46□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.46□□□□□ -1.05
PRAME-205ENST00000405655 C4orf26Q17RF5 130 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 IGLV7-43P04211 117 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 Q6ZSA8 131 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 LCE6AA0A183 80 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 CXCL6P80162 114 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 IGKV4-1P06312 121 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 SERP2Q8N6R1 65 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 MOBPQ13875 183 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 FAT1Q14517 4588 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 DSCR10P59022 87 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 LINC00483Q53H64 154 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 RYR3Q15413 4870 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-205ENST00000405655 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAME-205ENST00000405655 K7EQZ3 153 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-205ENST00000405655 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-205ENST00000405655 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-205ENST00000405655 A0A1B0GW54 56 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-205ENST00000405655 A0A087X002 238 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-205ENST00000405655 A0A1B0GVY2 172 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-205ENST00000405655 PRO0628Q9UI54 55 aa8.34□□□□□ -1.08
PRAME-205ENST00000405655 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-205ENST00000405655 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-205ENST00000405655 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-205ENST00000405655 Q96NJ1 140 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-205ENST00000405655 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 FAM236CP0DP71 79 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 C20orf197Q8N268 126 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 SNURFQ9Y675 71 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 OCR1Q9BZK8 76 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-205ENST00000405655 H7BZZ5 65 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 HCG22E2RYF7 251 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 PRR15Q8IV56 129 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 A8MWP4 228 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 HSPG2P98160 4391 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 KLKP1Q107X0 134 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
PRAME-205ENST00000405655 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.15□□□□□ -1.11
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