RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 CFC1P0CG37 223 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 TAL2Q16559 108 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 LINC00575Q6W349 94 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.81□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 A0A0B4J2C4 111 aa6.8□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 CD164Q04900 197 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 VAMP3Q15836 100 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 C12orf57Q99622 126 aa6.79□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 Q1RN00 199 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 CEND1Q8N111 149 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 LIMD2Q9BT23 127 aa6.77□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 hADV29S1A0JD25 119 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 Q5XG85 94 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 PRO1933Q9H354 126 aa6.76□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZQY7 126 aa6.75□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 FXYD2P54710 66 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 MT1HP80294 61 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 PCOTHQ58A44 107 aa6.74□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.73□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 GHRHP01286 108 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 RAB37Q96AX2 223 aa6.72□□□□□ -1.33
PRAME-204ENST00000403441 C9orf92A6NGG3 77 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 H0YGX0 51 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 HSD52Q0P140 79 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.71□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.7□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 H7C2G1 150 aa6.69□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 A0A0G2JQZ4 141 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GX51 115 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.68□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 Q6JHZ5 121 aa6.67□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 F8WEM9 126 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 IGFL1Q6UW32 110 aa6.66□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 M0R2T5 61 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 TRIAP1O43715 76 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 C1orf195Q5TG92 126 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 CLEC2BQ92478 149 aa6.65□□□□□ -1.34
PRAME-204ENST00000403441 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.63□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 K7ERJ3 54 aa6.62□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 SNCGO76070 127 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 SMIM6P0DI80 62 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 Q6Q795 121 aa6.61□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.6□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 TCL1BO95988 128 aa6.59□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRAME-204ENST00000403441 H3BUT2 72 aa6.58□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 H3BQ85 93 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 COX6CP09669 75 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 TEN1Q86WV5 123 aa6.55□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 TRACP01848 142 aa6.54□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 PSMB2P49721 201 aa6.54□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 H3BMG7 143 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 LST1O00453 97 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.53□□□□□ -1.36
PRAME-204ENST00000403441 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 DNAL4O96015 105 aa6.52□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 M0R143 59 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 FABP2P12104 132 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.51□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PNM2 257 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 UBE2V1Q13404 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 Q96NJ1 140 aa6.5□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 A0A087WSZ3 146 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.47□□□□□ -1.37
PRAME-204ENST00000403441 TSTD3H0UI37 97 aa6.46□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.45□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.44□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 Q75L30 129 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 CCKP06307 115 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 ATXN8Q156A1 80 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GV72 72 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.38□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.38□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 A8MUU9 505 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 DSCR8Q96T75 97 aa6.35□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.34□□□□□ -1.39
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