RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 Q5W150 140 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 CHD6Q8TD26 2715 aa6.02□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 A8MU10 97 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 DMAC1Q96GE9 116 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 ATRQ13535 2644 aa6.01□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 TNP2Q05952 138 aa5.99□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 CENPEQ02224 2701 aa5.98□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 SPRR1BP22528 89 aa5.96□□□□□ -1.45
HERC3-202ENST00000402738 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 LINC00483Q53H64 154 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.96□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.95□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 ITPR3Q14573 2671 aa5.93□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZR54 194 aa5.92□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 MAST4O15021 2626 aa5.91□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 ROMO1P60602 79 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.9□□□□□ -1.46
HERC3-202ENST00000402738 LCE6AA0A183 80 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 VCANP13611 3396 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.89□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 NOTCH1P46531 2555 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.88□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 MGAQ8IWI9 3026 aa5.87□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.87□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 TRIOO75962 3097 aa5.87□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 USP34Q70CQ2 3546 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.86□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 FRYQ5TBA9 3013 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 SPEGQ15772 3267 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.84□□□□□ -1.47
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 J3QL48 77 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.83□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 DNAH14Q0VDD8 3507 aa5.82□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 A0A087X002 238 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.81□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.8□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.79□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 S4R3F8 94 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 SZT2Q5T011 3432 aa5.78□□□□□ -1.48
HERC3-202ENST00000402738 COL6A5A8TX70 2615 aa5.77□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 KALRNO60229 2985 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 NDUFAF8A1L188 74 aa5.76□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 ITPR1Q14643 2758 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 ZNF292O60281 2723 aa5.74□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 STAB1Q9NY15 2570 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.73□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZSA8 131 aa5.72□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 PANO1I0J062 215 aa5.71□□□□□ -1.49
HERC3-202ENST00000402738 EYSQ5T1H1 3165 aa5.71□□□□□ -1.5
HERC3-202ENST00000402738 R4GN34 69 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC3-202ENST00000402738 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.69□□□□□ -1.5
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.68□□□□□ -1.5
HERC3-202ENST00000402738 LAMA1P25391 3075 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC3-202ENST00000402738 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.67□□□□□ -1.5
HERC3-202ENST00000402738 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 A8MUU9 505 aa5.64□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 M0QZ58 72 aa5.62□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 COL6A3P12111 3177 aa5.61□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
HERC3-202ENST00000402738 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.59□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 LRBAP50851 2863 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 M0R2T5 61 aa5.57□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 FRYLO94915 3013 aa5.56□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 APCP25054 2843 aa5.55□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-1P60331 282 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-2P60368 255 aa5.54□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
HERC3-202ENST00000402738 REV3LO60673 3130 aa5.53□□□□□ -1.52
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