RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PNM2 257 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 LRBAP50851 2863 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZSA8 131 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 Q75L30 129 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1W2PNN7 141 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP1-1Q07627 177 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP10-3P60369 221 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 HRES1P13985 223 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 DMAC1Q96GE9 116 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 TACC2O95359 2948 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0G2JQZ4 141 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 CASC10Q5T4H9 136 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 A0A1B0GU33 70 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRT-201ENST00000356100 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 SPRR1AP35321 89 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 SPRR1BP22528 89 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 Q8N1X5 172 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 TNP2Q05952 138 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 CSAG1Q6PB30 78 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 FRYLO94915 3013 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 NF1P21359 2839 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 C5orf42Q9H799 3197 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0D9SG42 100 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 S4R3F8 94 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 TENM3Q9P273 2699 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 UTRNP46939 3433 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRT-201ENST00000356100 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 KALRNO60229 2985 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 FRYQ5TBA9 3013 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 M0R2T5 61 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 TRIOO75962 3097 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 Q5W150 140 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 ZANQ9Y493 2812 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 TENM4Q6N022 2769 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 R4GN34 69 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 Q6ZR54 194 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRT-201ENST00000356100 ZZEF1O43149 2961 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 SPINK7P58062 85 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 PCNTO95613 3336 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 Q5VSD8 79 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 PDZD2O15018 2839 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 LCE6AA0A183 80 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 Q5VV11 94 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 OXTP01178 125 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 Q5XG85 94 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 ROMO1P60602 79 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRT-201ENST00000356100 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 PANO1I0J062 215 aa3.59□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 Q8NDZ9 215 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 PRAC1Q96KF2 57 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 M0QZ58 72 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 PLAC4Q8WY50 150 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 FBN2P35556 2912 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP10-1P60331 282 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRT-201ENST00000356100 HTTP42858 3142 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 A0A087X002 238 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 KRTAP10-2P60368 255 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 ATMQ13315 3056 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRT-201ENST00000356100 COL12A1Q99715 3063 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.3 ms