RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZSA8 131 aa2.95□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 PANO1I0J062 215 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 SPINK7P58062 85 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 HECTD1Q9ULT8 2610 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 R4GN34 69 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 Q5VSD8 79 aa2.9□□□□□ -1.94
PTPRD-201ENST00000355233 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 POLQO75417 2590 aa2.9□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 Q8N1X5 172 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 C9orf92A6NGG3 77 aa2.87□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 PLAC4Q8WY50 150 aa2.86□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 A8MUU9 505 aa2.85□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-1P60331 282 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRD-201ENST00000355233 ITPR3Q14573 2671 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0D9SG42 100 aa2.84□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 TNP1P09430 55 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0G2JQZ4 141 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 Q8NDZ9 215 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 M0R2T5 61 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 BPTFQ12830 3046 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-2P60368 255 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 ITPR2Q14571 2701 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 PRAC1Q96KF2 57 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 TRANK1O15050 2925 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
PTPRD-201ENST00000355233 USP24Q9UPU5 2620 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 ATRQ13535 2644 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 H0YAA0 97 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 CHD6Q8TD26 2715 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 EP400Q96L91 3159 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 UNC79Q9P2D8 2635 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP46Q8IYW2 2715 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF292O60281 2723 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 MAST4O15021 2626 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 P0C880 135 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 AKAP13Q12802 2813 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 APCP25054 2843 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 INE1O15225 51 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 TPRXLQ17RH7 258 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 STAB1Q9NY15 2570 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 NDUFAF8A1L188 74 aa2.67□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 NOTCH1P46531 2555 aa2.66□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 BAHCC1Q9P281 2608 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 COL6A5A8TX70 2615 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 RYR2Q92736 4967 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 IGSF10Q6WRI0 2623 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRD-201ENST00000355233 ITPR1Q14643 2758 aa2.58□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.58□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GVY2 172 aa2.58□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 CENPFP49454 3210 aa2.56□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.55□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 XP32Q5T750 250 aa2.55□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 A8MU10 97 aa2.54□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.54□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.53□□□□□ -2
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRD-201ENST00000355233 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP10-8P60410 259 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRD-201ENST00000355233 CHD9Q3L8U1 2897 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRD-201ENST00000355233 DNAH12Q6ZR08 3092 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRD-201ENST00000355233 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRD-201ENST00000355233 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 CHD7Q9P2D1 2997 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 TGP01266 2768 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 HIVEP1P15822 2718 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 A0A0C4DFX4 3053 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP12-1P59990 96 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRD-201ENST00000355233 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.41□□□□□ -2.02
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