RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087WTM6 91 aa5.19□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 A0A096LNT2 108 aa5.18□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 A0A087X002 238 aa5.18□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0G2JQZ4 141 aa5.17□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PNN7 141 aa5.17□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa5.16□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 S4R3F8 94 aa5.15□□□□□ -1.58
PKHD1-201ENST00000340994 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.15□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF575Q86XF7 245 aa5.14□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.14□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 OXTP01178 125 aa5.13□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 Q5W150 140 aa5.13□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 J3QL48 77 aa5.13□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZR54 194 aa5.13□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 SPRR1AP35321 89 aa5.12□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 SPRR1BP22528 89 aa5.11□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.1□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.1□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZSA8 131 aa5.09□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 A6NN06 94 aa5.09□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.09□□□□□ -1.59
PKHD1-201ENST00000340994 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.09□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 EP400Q96L91 3159 aa5.07□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP10-11P60412 298 aa5.06□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 R4GN34 69 aa5.06□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.05□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 K7EIL1 84 aa5.04□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.04□□□□□ -1.6
PKHD1-201ENST00000340994 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.01□□□□□ -1.61
PKHD1-201ENST00000340994 CEP350Q5VT06 3117 aa5□□□□□ -1.61
PKHD1-201ENST00000340994 LRBAP50851 2863 aa5□□□□□ -1.61
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PKHD1-201ENST00000340994 CASC10Q5T4H9 136 aa5□□□□□ -1.61
PKHD1-201ENST00000340994 LCE6AA0A183 80 aa4.99□□□□□ -1.61
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.98□□□□□ -1.61
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PKHD1-201ENST00000340994 PANO1I0J062 215 aa4.96□□□□□ -1.61
PKHD1-201ENST00000340994 A0A0C4DFX4 3053 aa4.96□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 TRANK1O15050 2925 aa4.95□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.94□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 Q8NDZ9 215 aa4.94□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 M0QZ58 72 aa4.93□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 FLNCQ14315 2725 aa4.92□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 CFAP54Q96N23 3096 aa4.91□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP4.9□□□□□ -1.62
PKHD1-201ENST00000340994 NDUFAF8A1L188 74 aa4.9□□□□□ -1.63
PKHD1-201ENST00000340994 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PKHD1-201ENST00000340994 PLAC4Q8WY50 150 aa4.89□□□□□ -1.63
PKHD1-201ENST00000340994 CHD9Q3L8U1 2897 aa4.88□□□□□ -1.63
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP10-3P60369 221 aa4.88□□□□□ -1.63
PKHD1-201ENST00000340994 M0R2T5 61 aa4.87□□□□□ -1.63
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PKHD1-201ENST00000340994 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.85□□□□□ -1.63
PKHD1-201ENST00000340994 PCNTO95613 3336 aa4.85□□□□□ -1.63
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PKHD1-201ENST00000340994 HIVEP1P15822 2718 aa4.83□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.83□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 PP632Q6XCG6 107 aa4.82□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 TENM3Q9P273 2699 aa4.81□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 MGAQ8IWI9 3026 aa4.81□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 NF1P21359 2839 aa4.81□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 FRYLO94915 3013 aa4.81□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.78□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 FRYQ5TBA9 3013 aa4.78□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 A8MUU9 505 aa4.78□□□□□ -1.64
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa4.77□□□□□ -1.65
PKHD1-201ENST00000340994 TGP01266 2768 aa4.77□□□□□ -1.65
PKHD1-201ENST00000340994 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.77□□□□□ -1.65
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.77□□□□□ -1.65
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.76□□□□□ -1.65
PKHD1-201ENST00000340994 CHD7Q9P2D1 2997 aa4.74□□□□□ -1.65
PKHD1-201ENST00000340994 C5orf42Q9H799 3197 aa4.74□□□□□ -1.65
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PKHD1-201ENST00000340994 TACC2O95359 2948 aa4.71□□□□□ -1.66
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PKHD1-201ENST00000340994 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.69□□□□□ -1.66
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.69□□□□□ -1.66
PKHD1-201ENST00000340994 A8MU10 97 aa4.68□□□□□ -1.66
PKHD1-201ENST00000340994 NBEAQ8NFP9 2946 aa4.66□□□□□ -1.66
PKHD1-201ENST00000340994 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.65□□□□□ -1.66
PKHD1-201ENST00000340994 Q5VSD8 79 aa4.64□□□□□ -1.67
PKHD1-201ENST00000340994 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.63□□□□□ -1.67
PKHD1-201ENST00000340994 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PKHD1-201ENST00000340994 TRIOO75962 3097 aa4.6□□□□□ -1.67
PKHD1-201ENST00000340994 P0C880 135 aa4.6□□□□□ -1.67
PKHD1-201ENST00000340994 ZANQ9Y493 2812 aa4.6□□□□□ -1.67
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.6□□□□□ -1.67
PKHD1-201ENST00000340994 KRTAP10-1P60331 282 aa4.58□□□□□ -1.68
PKHD1-201ENST00000340994 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PKHD1-201ENST00000340994 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PKHD1-201ENST00000340994 ZZEF1O43149 2961 aa4.57□□□□□ -1.68
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