RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620505.1

TARDBP-222, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 657 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	DDT	P30046	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	HERV-K104	P63124	156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	S100A12	P80511	92 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505		Q8N377	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505		Q9BRP9	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	HSBP1	O75506	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	NPC2	P61916	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	LEPROT	O15243	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC25A20	O43772	301 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505		Q6ZRX8	168 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505		J3QQQ9	107 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
TARDBP-222	ENST00000620505	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	COLCA2	A8K830	154 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	FABP4	P15090	132 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	TRGC2	P03986	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	SERF1A	O75920	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	DPM2	O94777	84 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	PLN	P26678	52 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	HERVK_113	P61574	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505		A0A0J9YXY3	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	NDUFC2	O95298	119 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	IGKC	P01834	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	NMU	P48645	174 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TARDBP-222	ENST00000620505	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505		H7C2G1	150 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	MT1H	P80294	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505		E9PLD3	99 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	SPRR1B	P22528	89 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BO	P23527	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BB	P33778	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BD	P58876	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BC	P62807	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505		Q1RN00	199 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	TAL2	Q16559	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	COX7B	P24311	80 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	LITAF	Q99732	161 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TARDBP-222	ENST00000620505	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TARDBP-222	ENST00000620505	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TARDBP-222	ENST00000620505	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TARDBP-222	ENST00000620505	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TARDBP-222	ENST00000620505	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TARDBP-222	ENST00000620505	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TARDBP-222	ENST00000620505	TIMM17B	O60830	172 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TARDBP-222	ENST00000620505	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66

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