RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GVX0 72 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 HRES1P13985 223 aa4.76□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 AKAP13Q12802 2813 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 K7EQZ3 153 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 RTL8CO15255 209 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 LITAFQ99732 161 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 C10orf142B7Z368 130 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 J3QL48 77 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 FAM104AQ969W3 186 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 WIPF1O43516 503 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 H7BZZ5 65 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 TNP2Q05952 138 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRT-209ENST00000612229 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 Q75L30 129 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 CDSNQ15517 529 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 C15orf56Q8N910 161 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF861PO60384 105 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 KLK9Q2XQG4 91 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 IGFL1Q6UW32 110 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV7-43P04211 117 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 EP400Q96L91 3159 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 CENPEQ02224 2701 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1B0GU33 70 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 Q8NAQ8 132 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PPR1 153 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 FAM168BA1KXE4 195 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 SMR3AQ99954 134 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 DSCR10P59022 87 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRT-209ENST00000612229 Q8N377 158 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 H3BS24 57 aa4.59□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 A0A0D9SG42 100 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP10-9P60411 292 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 PRR34Q9NV39 138 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 OCR1Q9BZK8 76 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 ATRQ13535 2644 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 CHD6Q8TD26 2715 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 Q6ZSA8 131 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 ITPR3Q14573 2671 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 MAST4O15021 2626 aa4.55□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 DNAH12Q6ZR08 3092 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 CSAG1Q6PB30 78 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 C9orf92A6NGG3 77 aa4.53□□□□□ -1.68
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF575Q86XF7 245 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 SPRR4Q96PI1 79 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 S4R3F8 94 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 SPINK7P58062 85 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 R4GN34 69 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 ROMO1P60602 79 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 Q5XG85 94 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 NOTCH1P46531 2555 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 M0R2T5 61 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 A0A1W2PNM2 257 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 Q8N1X5 172 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.69
PTPRT-209ENST00000612229 A0A087WTM6 91 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 COL6A5A8TX70 2615 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 STAB1Q9NY15 2570 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRT-209ENST00000612229 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
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