RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A096LNJ9	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM218	A2RU14	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00158	P58513	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932		A0A0U1RRA0	63 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	NCR3	O14931	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDUFA6	P56556	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	C10orf91	Q5T1B1	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q9BRP9	147 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	HBD	P02042	147 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	S100A12	P80511	92 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	COX19	Q49B96	90 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	SEC11C	Q9BY50	192 aa		4.83	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6ZRX8	168 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00614	P0C842	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	S100P	P25815	95 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	HERV-K104	P63124	156 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.8	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	DDT	P30046	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		4.79	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	NEB	P20929	6669 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	RHEB	Q15382	184 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q5XG85	94 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TOM1L1-223	ENST00000576932	APOC3	P02656	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	CD164	Q04900	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q6Q795	121 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	MT2A	P02795	61 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPRR1B	P22528	89 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932		A4D1N5	150 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDUFC2	O95298	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	SVBP	Q8N300	66 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.74	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	C20orf202	A1L168	122 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	SNAPIN	O95295	136 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TOM1L1-223	ENST00000576932	LEPROT	O15243	131 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.71	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	MT1F	P04733	61 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932		H7C2G1	150 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932		J3QQQ9	107 aa		4.69	□□□□□ -1.66
TOM1L1-223	ENST00000576932	NMU	P48645	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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