RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566121.1

CMTM3-212, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H2BDP58876 126 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H2BCP62807 126 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.58□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 TIMM17BO60830 172 aa8.57□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 ERC2-IT1O76042 136 aa8.57□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.57□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.56□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.56□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.55□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.55□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 S100A6P06703 90 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 Q8N377 158 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.54□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 SLC25A20O43772 301 aa8.53□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 LINC01545Q5VT33 79 aa8.53□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 LITAFQ99732 161 aa8.53□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 SPANXCQ9NY87 97 aa8.53□□□□□ -1.04
CMTM3-212ENST00000566121 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 SPRR1BP22528 89 aa8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 PET117Q6UWS5 81 aa8.52□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 MOBPQ13875 183 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.51□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.5□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.49□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.48□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CMTM3-212ENST00000566121 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.46□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 XP32Q5T750 250 aa8.45□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.45□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 COPS9Q8WXC6 57 aa8.44□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 S100A2P29034 98 aa8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 AKR1D1P51857 326 aa8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 NPC2P61916 151 aa8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 Q6ZVH6 145 aa8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.43□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 ZNF815PA8K554 130 aa8.42□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 C3orf79P0CE67 100 aa8.42□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 CD164Q04900 197 aa8.42□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 IFITM1P13164 125 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.41□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 Q5XG85 94 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 LIMD2Q9BT23 127 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.4□□□□□ -1.06
CMTM3-212ENST00000566121 COX7BP24311 80 aa8.39□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 C6orf99Q4VX62 202 aa8.37□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 A4D1N5 150 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.36□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 A0A1B0GWB2 263 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 C20orf202A1L168 122 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.35□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.34□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 PRO1933Q9H354 126 aa8.34□□□□□ -1.07
CMTM3-212ENST00000566121 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 KRTDAPP60985 99 aa8.32□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 TAL2Q16559 108 aa8.32□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM29Q86T20 159 aa8.32□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.31□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.3□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.29□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 H7C2G1 150 aa8.28□□□□□ -1.08
CMTM3-212ENST00000566121 A6NDN8 102 aa8.26□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM6P0DI80 62 aa8.26□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 PCP2Q8IVA1 136 aa8.26□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 Q1RN00 199 aa8.25□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 PYY3Q5JQD4 70 aa8.25□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 SCGB1D1O95968 90 aa8.24□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 LCE2CQ5TA81 110 aa8.24□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.24□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 C1orf195Q5TG92 126 aa8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.23□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 VAMP3Q15836 100 aa8.22□□□□□ -1.09
CMTM3-212ENST00000566121 ATOH7Q8N100 152 aa8.21□□□□□ -1.1
CMTM3-212ENST00000566121 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
CMTM3-212ENST00000566121 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.19□□□□□ -1.1
CMTM3-212ENST00000566121 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.19□□□□□ -1.1
CMTM3-212ENST00000566121 TCL1BO95988 128 aa8.19□□□□□ -1.1
CMTM3-212ENST00000566121 PCOTHQ58A44 107 aa8.19□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms