RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		7.41	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	FAM229A	H3BQW9	127 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	DIRC1	Q969H9	104 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		7.4	□□□□□ -1.22
DDB1-223	ENST00000543658		K7ERJ3	54 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2A	P49459	152 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		7.39	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GWB2	263 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	BCE1	O60756	84 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.37	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	PSMB2	P49721	201 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	VAMP3	Q15836	100 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	C6orf99	Q4VX62	202 aa		7.36	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	COX6C	P09669	75 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	COX7B	P24311	80 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR1A	P35321	89 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658		Q5VSD8	79 aa		7.34	□□□□□ -1.23
DDB1-223	ENST00000543658	TSPAN13	O95857	204 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV7-43	P04211	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	PRLH	P81277	87 aa		7.33	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZRX8	168 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658		Q8N1X5	172 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		7.32	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658		B5MCH6	92 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	SLC25A20	O43772	301 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	SNCG	O76070	127 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		7.31	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658		H0Y9J4	135 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	TRIAP1	O43715	76 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF861P	O60384	105 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		7.3	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658		H0YGX0	51 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		7.29	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	RYR1	P21817	5038 aa		7.28	□□□□□ -1.24
DDB1-223	ENST00000543658	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		7.27	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658		H3BUT2	72 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		7.26	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	hADV29S1	A0JD25	119 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	C9orf118	A6NHY6	69 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	TAX1BP3	O14907	124 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658		Q9BRP9	147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	DNAL4	O96015	105 aa		7.24	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	LINC00575	Q6W349	94 aa		7.24	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	HSPG2	P98160	4391 aa		7.24	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GX51	115 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	CLEC2B	Q92478	149 aa		7.23	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1B0GV90	55 aa		7.22	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	FABP2	P12104	132 aa		7.22	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PPM0	123 aa		7.21	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	GHRH	P01286	108 aa		7.21	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	ATXN8	Q156A1	80 aa		7.21	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		7.21	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.2	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	HERC2	O95714	4834 aa		7.2	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	LCE2C	Q5TA81	110 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658		Q6ZQY7	126 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		7.19	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	LST1	O00453	97 aa		7.18	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		7.18	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		7.18	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.18	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	TCL1B	O95988	128 aa		7.17	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	TRAC	P01848	142 aa		7.17	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		7.17	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658		H3BQ85	93 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	FAT1	Q14517	4588 aa		7.16	□□□□□ -1.26
DDB1-223	ENST00000543658	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		7.14	□□□□□ -1.27
DDB1-223	ENST00000543658	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.14	□□□□□ -1.27
DDB1-223	ENST00000543658	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		7.13	□□□□□ -1.27
DDB1-223	ENST00000543658		F8WEM9	126 aa		7.13	□□□□□ -1.27
DDB1-223	ENST00000543658	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.13	□□□□□ -1.27
DDB1-223	ENST00000543658	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		7.13	□□□□□ -1.27
DDB1-223	ENST00000543658	CRYGA	P11844	174 aa		7.12	□□□□□ -1.27

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