RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFC2O95298 119 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKCP01834 107 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZRX8 168 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.63□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A2P29034 98 aa6.62□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 NMUP48645 174 aa6.62□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.62□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.62□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0J9YXY3 114 aa6.61□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8N377 158 aa6.61□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 E9PLD3 99 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 MOBPQ13875 183 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 LITAFQ99732 161 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.6□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 HERVK_113P61574 105 aa6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
CLSTN3-211ENST00000541667 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.58□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 NPC2P61916 151 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A12P80511 92 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.57□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.56□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.55□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 SPRR1BP22528 89 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01545Q5VT33 79 aa6.54□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A20O43772 301 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 TIMM17BO60830 172 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 C3orf79P0CE67 100 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTDAPP60985 99 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.53□□□□□ -1.36
CLSTN3-211ENST00000541667 AKR1D1P51857 326 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 XP32Q5T750 250 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 SPANXCQ9NY87 97 aa6.52□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 C20orf202A1L168 122 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 PET117Q6UWS5 81 aa6.51□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM6P0DI80 62 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE2CQ5TA81 110 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.49□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF815PA8K554 130 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 PYY3Q5JQD4 70 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.48□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.47□□□□□ -1.37
CLSTN3-211ENST00000541667 SCGB1D1O95968 90 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 C6orf99Q4VX62 202 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM29Q86T20 159 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.46□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.45□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 COX7BP24311 80 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.44□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.43□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 ATOH7Q8N100 152 aa6.42□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 CD164Q04900 197 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 Q1RN00 199 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 VAMP8Q9BV40 100 aa6.41□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0G2JQZ4 141 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 TAL2Q16559 108 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 Q5XG85 94 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 PCP2Q8IVA1 136 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.4□□□□□ -1.38
CLSTN3-211ENST00000541667 IFITM1P13164 125 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 PCOTHQ58A44 107 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 C12orf57Q99622 126 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 LIMD2Q9BT23 127 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 PRO1933Q9H354 126 aa6.39□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GWB2 263 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 C9orf92A6NGG3 77 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 SPATA45Q537H7 98 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.38□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 C1orf195Q5TG92 126 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZVH6 145 aa6.37□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 A6NDN8 102 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 H7C2G1 150 aa6.36□□□□□ -1.39
CLSTN3-211ENST00000541667 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.36□□□□□ -1.39
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