RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 SPG11Q96JI7 2443 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 MUC4Q99102 2169 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 LINC01554Q52M75 96 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 Q6ZSN1 163 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.16□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 INAFM1C9JVW0 142 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 C19orf73Q9NVV2 129 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 CSPG4Q6UVK1 2322 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 NBEAQ8NFP9 2946 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRD-214ENST00000540109 SPINK1P00995 79 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 Q75L30 129 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 PTPN13Q12923 2485 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 KALRNO60229 2985 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 COA5Q86WW8 74 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.14□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 FLNCQ14315 2725 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 A0A087WSZ3 146 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 LRBAP50851 2863 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 H3BNG1 76 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 ZZEF1O43149 2961 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 IGLV6-57P01721 117 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00313P59037 77 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA0087Q14695 138 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 FAM104AQ969W3 186 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 A8MWP4 228 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 Q6ZRP5 223 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.1□□□□□ -1.75
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PTPRD-214ENST00000540109 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 DEFB135Q30KP9 77 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRD-214ENST00000540109 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 EPG5Q9HCE0 2579 aa4.09□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 FAM229AH3BQW9 127 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 X6R8D5 127 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 ITPR3Q14573 2671 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 EPM2AB3EWF7 344 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 KRTAP10-3P60369 221 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 OCR1Q9BZK8 76 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 K7EQZ3 153 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 LAMA5O15230 3695 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 M0R2N4 97 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 NOTCH2Q04721 2471 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 HIVEP2P31629 2446 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 POLQO75417 2590 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 C16orf90A8MZG2 172 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 Q6ZRX8 168 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRD-214ENST00000540109 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 CSAG1Q6PB30 78 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 PRLHP81277 87 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 SMR3AQ99954 134 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
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PTPRD-214ENST00000540109 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 DMAC1Q96GE9 116 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 Q8NAQ8 132 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 TACC2O95359 2948 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 FBN2P35556 2912 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 Q5VV11 94 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRD-214ENST00000540109 C7orf33Q8WU49 177 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-214ENST00000540109 F8P00451 2351 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRD-214ENST00000540109 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRD-214ENST00000540109 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
PTPRD-214ENST00000540109 CRIPTQ9P021 101 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-214ENST00000540109 TEX15Q9BXT5 2789 aa4□□□□□ -1.77
PTPRD-214ENST00000540109 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
PTPRD-214ENST00000540109 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
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