RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534197.5

GNPTG-209, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 3

Gene GNPTG, Length 420 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-209	ENST00000534197	DPM2	O94777	84 aa		12.19	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		12.19	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	NMU	P48645	174 aa		12.18	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	XP32	Q5T750	250 aa		12.18	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	IGKC	P01834	107 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	HERVK_113	P61574	105 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		12.17	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197		A0A0J9YXY3	114 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		12.15	□□□□□ -0.46
GNPTG-209	ENST00000534197	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	12.13	□□□□□ -0.47
GNPTG-209	ENST00000534197	LCE2C	Q5TA81	110 aa		12.11	□□□□□ -0.47
GNPTG-209	ENST00000534197		E9PLD3	99 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GNPTG-209	ENST00000534197	LITAF	Q99732	161 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		12.06	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	COLCA2	A8K830	154 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	SPRR1B	P22528	89 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		12.05	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	C5orf52	A6NGY3	159 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		12.04	□□□□□ -0.48
GNPTG-209	ENST00000534197	SPANXC	Q9NY87	97 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	PCOTH	Q58A44	107 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	C9orf92	A6NGG3	77 aa		11.98	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		11.97	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	TIMM17B	O60830	172 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	SLC7A5P1	Q8MH63	180 aa		11.96	□□□□□ -0.49
GNPTG-209	ENST00000534197	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	LIMD2	Q9BT23	127 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	MT1H	P80294	61 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	C6orf99	Q4VX62	202 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	LINC01545	Q5VT33	79 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		11.94	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	ZNF815P	A8K554	130 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197		Q1RN00	199 aa		11.93	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	COX7B	P24311	80 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		11.92	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197		H7C2G1	150 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BK	O60814	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BO	P23527	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BB	P33778	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BD	P58876	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BC	P62807	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		11.9	□□□□□ -0.5
GNPTG-209	ENST00000534197		A0A0G2JQZ4	141 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	TAL2	Q16559	108 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	SMIM29	Q86T20	159 aa		11.88	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	CD164	Q04900	197 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	PET117	Q6UWS5	81 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	PRO1933	Q9H354	126 aa		11.85	□□□□□ -0.51
GNPTG-209	ENST00000534197	C3orf79	P0CE67	100 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GNPTG-209	ENST00000534197	C1orf195	Q5TG92	126 aa		11.82	□□□□□ -0.52
GNPTG-209	ENST00000534197		Q5XG85	94 aa		11.81	□□□□□ -0.52
GNPTG-209	ENST00000534197	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		11.8	□□□□□ -0.52
GNPTG-209	ENST00000534197	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		11.79	□□□□□ -0.52
GNPTG-209	ENST00000534197	AKR1D1	P51857	326 aa		11.79	□□□□□ -0.52
GNPTG-209	ENST00000534197	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		11.78	□□□□□ -0.52
GNPTG-209	ENST00000534197		A0A1B0GWB2	263 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		11.77	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197		A6NDN8	102 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	KRTDAP	P60985	99 aa		11.75	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	CFC1B	P0CG36	223 aa		11.74	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		11.73	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	IFITM1	P13164	125 aa		11.72	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	PCP2	Q8IVA1	136 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	ATOH7	Q8N100	152 aa		11.71	□□□□□ -0.53
GNPTG-209	ENST00000534197	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
GNPTG-209	ENST00000534197	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		11.69	□□□□□ -0.54
GNPTG-209	ENST00000534197	COPS9	Q8WXC6	57 aa		11.67	□□□□□ -0.54
GNPTG-209	ENST00000534197		Q6ZVH6	145 aa		11.66	□□□□□ -0.54
GNPTG-209	ENST00000534197		A4D1N5	150 aa		11.65	□□□□□ -0.54
GNPTG-209	ENST00000534197	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GNPTG-209	ENST00000534197	C20orf202	A1L168	122 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GNPTG-209	ENST00000534197		M0R2T5	61 aa		11.61	□□□□□ -0.55
GNPTG-209	ENST00000534197	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
GNPTG-209	ENST00000534197	TCL1B	O95988	128 aa		11.6	□□□□□ -0.55
GNPTG-209	ENST00000534197	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		11.59	□□□□□ -0.55

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