RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533686.5

PACSIN3-210, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 443 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-210ENST00000533686 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.98□□□□□ -0.81
PACSIN3-210ENST00000533686 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.97□□□□□ -0.81
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.97□□□□□ -0.81
PACSIN3-210ENST00000533686 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
PACSIN3-210ENST00000533686 OXTP01178 125 aa9.97□□□□□ -0.81
PACSIN3-210ENST00000533686 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.95□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.95□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 A4D1N5 150 aa9.95□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 PRLHP81277 87 aa9.95□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 TAL2Q16559 108 aa9.95□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.94□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 A6NDN8 102 aa9.92□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 B5MCH6 92 aa9.92□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC01600Q96MT4 127 aa9.91□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PACSIN3-210ENST00000533686 Q6ZRX8 168 aa9.89□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 CEND1Q8N111 149 aa9.89□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.88□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 HSD52Q0P140 79 aa9.88□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.88□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa9.86□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 CFC1BP0CG36 223 aa9.86□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 CFC1P0CG37 223 aa9.86□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 C6orf99Q4VX62 202 aa9.86□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.86□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.85□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 A6NJY4 79 aa9.85□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 J3QL48 77 aa9.85□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.85□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 C12orf57Q99622 126 aa9.85□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 Q9BRP9 147 aa9.85□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 PRO1933Q9H354 126 aa9.85□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A0B4J2C4 111 aa9.84□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 COX7BP24311 80 aa9.84□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
PACSIN3-210ENST00000533686 MT1HL1P0DM35 61 aa9.83□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 FXYD2P54710 66 aa9.83□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 KRTAP10-8P60410 259 aa9.83□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 RAB37Q96AX2 223 aa9.83□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 TNXBP22105 4242 aa9.83□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1B0GWB2 263 aa9.82□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 SPRR4Q96PI1 79 aa9.81□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.81□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 ERC2-IT1O76042 136 aa9.8□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.8□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.79□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 TSTD3H0UI37 97 aa9.78□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 VAMP3Q15836 100 aa9.78□□□□□ -0.84
PACSIN3-210ENST00000533686 CRYGAP11844 174 aa9.77□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.77□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.77□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A087X002 238 aa9.75□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00483Q53H64 154 aa9.75□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.75□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 H7C2G1 150 aa9.74□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 CTAG1AP78358 180 aa9.74□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.73□□□□□ -0.85
PACSIN3-210ENST00000533686 M0R143 59 aa9.71□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 SLC25A20O43772 301 aa9.71□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 Q1RN00 199 aa9.71□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.71□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00575Q6W349 94 aa9.71□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.71□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.7□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 H0YGX0 51 aa9.69□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 K7ERJ3 54 aa9.69□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 SPRR1BP22528 89 aa9.69□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 HERC1Q15751 4861 aa9.69□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 hADV29S1A0JD25 119 aa9.67□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.66□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.65□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.65□□□□□ -0.86
PACSIN3-210ENST00000533686 TRIAP1O43715 76 aa9.64□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 TSPAN13O95857 204 aa9.64□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 SNCGO76070 127 aa9.63□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.63□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 A0A1B0GX51 115 aa9.62□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 PSMB2P49721 201 aa9.62□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 COX6CP09669 75 aa9.61□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 Q6ZQY7 126 aa9.61□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.61□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.61□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.6□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8N377 158 aa9.6□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.6□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.59□□□□□ -0.87
PACSIN3-210ENST00000533686 MOBPQ13875 183 aa9.58□□□□□ -0.88
PACSIN3-210ENST00000533686 SMIM29Q86T20 159 aa9.58□□□□□ -0.88
PACSIN3-210ENST00000533686 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.57□□□□□ -0.88
PACSIN3-210ENST00000533686 Q8NBF4 154 aa9.57□□□□□ -0.88
PACSIN3-210ENST00000533686 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.57□□□□□ -0.88
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