RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532872.5

RPS3-218, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 3

Gene RPS3, Length 737 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-218ENST00000532872 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.34□□□□□ -1.23
RPS3-218ENST00000532872 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.34□□□□□ -1.23
RPS3-218ENST00000532872 DAND5Q8N907 189 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.33□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 Q8NBF4 154 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.32□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 B5MCH6 92 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 DDTP30046 118 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 LINC00483Q53H64 154 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.31□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 C5orf52A6NGY3 159 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.3□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 TIMM17BO60830 172 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 SPINK1P00995 79 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 MUC17Q685J3 4493 aa7.29□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 A0A0J9YXY3 114 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 NDUFC2O95298 119 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 Q6ZRX8 168 aa7.28□□□□□ -1.24
RPS3-218ENST00000532872 ZNF815PA8K554 130 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 ERC2-IT1O76042 136 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 IGLV6-57P01721 117 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 COPS9Q8WXC6 57 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 Q9BRP9 147 aa7.27□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.26□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 MOBPQ13875 183 aa7.26□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 Q6ZVH6 145 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.25□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.24□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 NPC2P61916 151 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.23□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 SCGB1D1O95968 90 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 ATOH7Q8N100 152 aa7.22□□□□□ -1.25
RPS3-218ENST00000532872 IFITM1P13164 125 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.21□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 Q8N377 158 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 LITAFQ99732 161 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 SPANXCQ9NY87 97 aa7.2□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 SLC25A20O43772 301 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 SVIPQ8NHG7 77 aa7.19□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.18□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.17□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 PCP2Q8IVA1 136 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.16□□□□□ -1.26
RPS3-218ENST00000532872 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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RPS3-218ENST00000532872 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.14□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 SPRR1BP22528 89 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.13□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 COX8AP10176 69 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 VAMP8Q9BV40 100 aa7.12□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.11□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 COX7BP24311 80 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 XP32Q5T750 250 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.1□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 C6orf99Q4VX62 202 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 SPATA45Q537H7 98 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 LIMD2Q9BT23 127 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.09□□□□□ -1.27
RPS3-218ENST00000532872 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 HIST1H4GQ99525 98 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 HIGD1BQ9P298 99 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.07□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 A6NDN8 102 aa7.06□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 TAL2Q16559 108 aa7.06□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 A4D1N5 150 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 Q1RN00 199 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 PYY3Q5JQD4 70 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 C14orf144Q96I85 54 aa7.05□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.04□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 A6NJY4 79 aa7.04□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.04□□□□□ -1.28
RPS3-218ENST00000532872 A0A1B0GWB2 263 aa7.03□□□□□ -1.28
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