RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 SYCNQ0VAF6 134 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 C3orf84H3BNL1 204 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZTC4 211 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 C7orf33Q8WU49 177 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 A0A0U1RQV1 116 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 INAFM1C9JVW0 142 aa7.49□□□□□ -1.21
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PTPRK-217ENST00000524534 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 A0A1B0GW54 56 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRK-217ENST00000524534 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-217ENST00000524534 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRK-217ENST00000524534 Q6ZRX8 168 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRK-217ENST00000524534 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRK-217ENST00000524534 TNP2Q05952 138 aa7.45□□□□□ -1.22
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PTPRK-217ENST00000524534 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-217ENST00000524534 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 20.3
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PTPRK-217ENST00000524534 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.41□□□□□ -1.22
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PTPRK-217ENST00000524534 Q1T7F1 81 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-217ENST00000524534 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-217ENST00000524534 A0A087WSZ3 146 aa7.22□□□□□ -1.25
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PTPRK-217ENST00000524534 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-217ENST00000524534 A0A096LNI7 61 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRK-217ENST00000524534 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRK-217ENST00000524534 C16orf90A8MZG2 172 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRK-217ENST00000524534 NDUFB1O75438 58 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-217ENST00000524534 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.19□□□□□ -1.26
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