RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-222ENST00000512014 MUC17Q685J3 4493 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 B5MCH6 92 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 NDUFC2O95298 119 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 IGLV6-57P01721 117 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 SMIM6P0DI80 62 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 DDTP30046 118 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 S100A12P80511 92 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 ERC2-IT1O76042 136 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 NPC2P61916 151 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 Q9BRP9 147 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 MUC2Q02817 5179 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 SPATA45Q537H7 98 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 LINC00483Q53H64 154 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 CTAG1AP78358 180 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 TIMM17BO60830 172 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 Q6ZRX8 168 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 C12orf57Q99622 126 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF815PA8K554 130 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 PCP2Q8IVA1 136 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 C14orf144Q96I85 54 aa7.26□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 COX8AP10176 69 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 Q8NBF4 154 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 SPANXCQ9NY87 97 aa7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 DLEU1O43261 78 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 TPRXLQ17RH7 258 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 PRO1933Q9H354 126 aa7.22□□□□□ -1.25
SH3BP2-222ENST00000512014 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.21□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 MOBPQ13875 183 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.2□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 TSTD3H0UI37 97 aa7.19□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 SPINK1P00995 79 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.18□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.17□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 SPRR1BP22528 89 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 Q8N377 158 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 HIGD1BQ9P298 99 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.16□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 C6orf99Q4VX62 202 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 Q6ZVH6 145 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 HIST1H4GQ99525 98 aa7.15□□□□□ -1.26
SH3BP2-222ENST00000512014 IFITM1P13164 125 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 COPS9Q8WXC6 57 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 CDIP1Q9H305 208 aa7.14□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 COX7BP24311 80 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.13□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 TAL2Q16559 108 aa7.12□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 HSD52Q0P140 79 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2-222ENST00000512014 SMIM29Q86T20 159 aa7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 CEND1Q8N111 149 aa7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 A0A1B0GWB2 263 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 A6NDN8 102 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 SLC25A20O43772 301 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 A4D1N5 150 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 A6NJY4 79 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 M0R143 59 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.05□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.04□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 Q1RN00 199 aa7.04□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.04□□□□□ -1.28
SH3BP2-222ENST00000512014 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms