RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	SMIM13	P0DJ93	91 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC01546	A6NGU7	62 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	BAGE3	Q86Y29	109 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5.84	□□□□□ -1.47
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV6-57	P01721	117 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DDT	P30046	118 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZRX8	168 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511		Q9BRP9	147 aa		5.82	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00587	B1AMM8	73 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	S100P	P25815	95 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	FABP9	Q0Z7S8	132 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.81	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HBD	P02042	147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HERV-K104	P63124	156 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		5.8	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	USH2A	O75445	5202 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A096LNJ9	63 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.78	□□□□□ -1.48
SKAP2-209	ENST00000497511	COX19	Q49B96	90 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6Q795	121 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC11C	Q9BY50	192 aa		5.77	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SSPO	A2VEC9	5147 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LINC00614	P0C842	121 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.76	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	COMMD7	Q86VX2	200 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		5.74	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511		H7C2G1	150 aa		5.73	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf52	A6NGY3	159 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CFC1	P0CG37	223 aa		5.71	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFC2	O95298	119 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511		Q1RN00	199 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.69	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511		H0Y8G0	127 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRR1B	P22528	89 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	NPC2	P61916	151 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	IFITM2	Q01629	132 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	CD164	Q04900	197 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TAL2	Q16559	108 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.67	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS10P5	Q9NQ39	176 aa		5.67	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM218	A2RU14	115 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		5.66	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LEPROT	O15243	131 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.65	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1D1	P51857	326 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511	RHEB	Q15382	184 aa		5.65	□□□□□ -1.5
SKAP2-209	ENST00000497511		J3QQQ9	107 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	HERVK_113	P61574	105 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	UQCC3	Q6UW78	93 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		5.64	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	NMU	P48645	174 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511		Q5XG85	94 aa		5.63	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	TCL1B	O95988	128 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	COX7B	P24311	80 aa		5.62	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD1	Q96BP2	118 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	CLLU1	Q5K131	121 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	HSBP1	O75506	76 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PLN	P26678	52 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511		Q75L30	129 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	PCP2	Q8IVA1	136 aa		5.6	□□□□□ -1.51
SKAP2-209	ENST00000497511	C20orf202	A1L168	122 aa		5.59	□□□□□ -1.51

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