RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 A0A087WVE0 104 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 DPM2O94777 84 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 HTN1P15515 57 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 ALX1Q15699 326 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-0.83□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
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CMC1-211ENST00000495428 PAEPP09466 180 aa-0.84□□□□□ -2.54
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CMC1-211ENST00000495428 TMEM244Q5VVB8 128 aa-0.84□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 BANF2Q9H503 90 aa-0.84□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 CALML5Q9NZT1 146 aa-0.84□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-0.84□□□□□ -2.54
CMC1-211ENST00000495428 LINC01546A6NGU7 62 aa-0.85□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-0.85□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-0.86□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 Q8IZM0 81 aa-0.86□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa-0.87□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 J3QLW9 94 aa-0.88□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-0.88□□□□□ -2.55
CMC1-211ENST00000495428 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.88□□□□□ -2.55
CMC1-211ENST00000495428 UQCRHLA0A096LP55 91 aa-0.89□□□□□ -2.55
CMC1-211ENST00000495428 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.89□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.89□□□□□ -2.55
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CMC1-211ENST00000495428 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.91□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 C5orf38Q86SI9 138 aa-0.91□□□□□ -2.56
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CMC1-211ENST00000495428 V9GYQ6 96 aa-0.91□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.92□□□□□ -2.56
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CMC1-211ENST00000495428 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 COX14Q96I36 57 aa-0.93□□□□□ -2.56
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CMC1-211ENST00000495428 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.95□□□□□ -2.56
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CMC1-211ENST00000495428 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-0.96□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 TSTD3H0UI37 97 aa-0.96□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 C9orf153Q5TBE3 101 aa-0.96□□□□□ -2.56
CMC1-211ENST00000495428 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.96□□□□□ -2.56
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