RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490447.6

YIPF3-208, Transcript of Yip1 domain family member 3, humanhuman

TSL 2

Gene YIPF3, Length 1,321 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3-208ENST00000490447 DAND5Q8N907 189 aa10.12□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 Q8NBF4 154 aa10.12□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 C12orf57Q99622 126 aa10.12□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.11□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 NMUP48645 174 aa10.11□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.1□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 HERV-K104P63124 156 aa10.09□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.09□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 SMCR5Q8TEV8 140 aa10.09□□□□□ -0.79
YIPF3-208ENST00000490447 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.08□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 LINC00587B1AMM8 73 aa10.08□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 SPINK1P00995 79 aa10.08□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 KCNQ1DNQ9H478 68 aa10.08□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 COX8AP10176 69 aa10.07□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 SPRR1AP35321 89 aa10.07□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 TSPEAR-AS2P59090 65 aa10.07□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 NDUFA12Q9UI09 145 aa10.07□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.07□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 ZNF815PA8K554 130 aa10.06□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 DLEU1O43261 78 aa10.06□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 PCP2Q8IVA1 136 aa10.06□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa10.05□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 GAGE2AQ6NT46 116 aa10.05□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.05□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 C14orf144Q96I85 54 aa10.05□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.04□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 LINC00483Q53H64 154 aa10.04□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.03□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.03□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.03□□□□□ -0.8
YIPF3-208ENST00000490447 TSTD3H0UI37 97 aa10.02□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 MOBPQ13875 183 aa10.02□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 SCGB1D4Q6XE38 83 aa10.02□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 UQCR10Q9UDW1 63 aa10.02□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 A0A0J9YXY3 114 aa10□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 B5MCH6 92 aa10□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 DDTP30046 118 aa10□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 TIMM17BO60830 172 aa9.99□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.99□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 PRO1933Q9H354 126 aa9.99□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.98□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.97□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 HIGD1BQ9P298 99 aa9.97□□□□□ -0.81
YIPF3-208ENST00000490447 SLC25A20O43772 301 aa9.96□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 ERC2-IT1O76042 136 aa9.96□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 Q8N377 158 aa9.96□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.95□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 Q6ZRX8 168 aa9.95□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.94□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 Q6ZVH6 145 aa9.94□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.94□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 Q9BRP9 147 aa9.94□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.93□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.92□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 COPS9Q8WXC6 57 aa9.92□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 LITAFQ99732 161 aa9.92□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 SPANXDQ9BXN6 97 aa9.91□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 SPANXCQ9NY87 97 aa9.91□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.9□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 NDUFC2O95298 119 aa9.9□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 TAL2Q16559 108 aa9.9□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.9□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.9□□□□□ -0.82
YIPF3-208ENST00000490447 IFITM1P13164 125 aa9.89□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 HIST1H4GQ99525 98 aa9.89□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 IGLV6-57P01721 117 aa9.88□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 HSD52Q0P140 79 aa9.86□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 XP32Q5T750 250 aa9.86□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 NPC2P61916 151 aa9.85□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.85□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.85□□□□□ -0.83
YIPF3-208ENST00000490447 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.83□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 CEND1Q8N111 149 aa9.82□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.82□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 LIMD2Q9BT23 127 aa9.82□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.81□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 A6NJY4 79 aa9.81□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 M0R143 59 aa9.81□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.81□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 PCP4L1A6NKN8 68 aa9.8□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.78□□□□□ -0.84
YIPF3-208ENST00000490447 A4D1N5 150 aa9.77□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.77□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.76□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.76□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.75□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 FXYD2P54710 66 aa9.74□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 A6NDN8 102 aa9.73□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 C9orf92A6NGG3 77 aa9.73□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 SPRR1BP22528 89 aa9.73□□□□□ -0.85
YIPF3-208ENST00000490447 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms