RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486441.1

SDCCAG3-211, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 5

Gene SDCCAG3, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-211ENST00000486441 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.61□□□□□ -1.19
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SDCCAG3-211ENST00000486441 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.6□□□□□ -1.19
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SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.59□□□□□ -1.19
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SDCCAG3-211ENST00000486441 SPANXCQ9NY87 97 aa7.4□□□□□ -1.22
SDCCAG3-211ENST00000486441 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.39□□□□□ -1.23
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SDCCAG3-211ENST00000486441 S100A2P29034 98 aa7.38□□□□□ -1.23
SDCCAG3-211ENST00000486441 HERVK_113P61574 105 aa7.38□□□□□ -1.23
SDCCAG3-211ENST00000486441 C6orf99Q4VX62 202 aa7.38□□□□□ -1.23
SDCCAG3-211ENST00000486441 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.38□□□□□ -1.23
SDCCAG3-211ENST00000486441 C14orf144Q96I85 54 aa7.38□□□□□ -1.23
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SDCCAG3-211ENST00000486441 Q6Q795 121 aa7.33□□□□□ -1.24
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SDCCAG3-211ENST00000486441 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.32□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 LCE2BO14633 110 aa7.3□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.3□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 Q75L30 129 aa7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 MT2AP02795 61 aa7.28□□□□□ -1.24
SDCCAG3-211ENST00000486441 TCL1BO95988 128 aa7.27□□□□□ -1.25
SDCCAG3-211ENST00000486441 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.27□□□□□ -1.25
SDCCAG3-211ENST00000486441 A0A1B0GWB2 263 aa7.26□□□□□ -1.25
SDCCAG3-211ENST00000486441 PCP4P48539 62 aa7.26□□□□□ -1.25
SDCCAG3-211ENST00000486441 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.25□□□□□ -1.25
SDCCAG3-211ENST00000486441 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.25□□□□□ -1.25
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