RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470322.5

ACTR1A-202, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene ACTR1A, Length 3,519 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1A-202ENST00000470322 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 F8WDY8 70 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 M0R2N4 97 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.3□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 NREPQ16612 68 aa6.29□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 IMUPQ9GZP8 106 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 NDUFC2O95298 119 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 C22orf24Q9Y442 160 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 TENM2Q9NT68 2774 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 FAM168BA1KXE4 195 aa6.28□□□□□ -1.4
ACTR1A-202ENST00000470322 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 Q6ZRP5 223 aa6.27□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 M0R378 163 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 CASC10Q5T4H9 136 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 Q6JHZ5 121 aa6.26□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 RMI2Q96E14 147 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 A0A0G2JQZ4 141 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 A0A1W2PNN7 141 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 Q6ZVQ6 151 aa6.25□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 F8WEM9 126 aa6.24□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.24□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 MUC7Q8TAX7 377 aa6.24□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.23□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 PRR34Q9NV39 138 aa6.23□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.22□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 BPY2O14599 106 aa6.22□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 C7orf33Q8WU49 177 aa6.22□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 C15orf56Q8N910 161 aa6.22□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.22□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 PRLHP81277 87 aa6.21□□□□□ -1.41
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.21□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 IGLV6-57P01721 117 aa6.21□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 VPREB1P12018 145 aa6.21□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 Q6ZQT0 140 aa6.2□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 PRR4Q16378 134 aa6.19□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 CHTF8P0CG12 524 aa6.18□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.18□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC00167Q96N53 147 aa6.18□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.17□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.17□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 PSPHP1O15172 72 aa6.17□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.17□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.17□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 PDE6GP18545 87 aa6.16□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 C1orf137Q5JT78 98 aa6.16□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 UBE2AP49459 152 aa6.15□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 PMAIP1Q13794 54 aa6.15□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.15□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.15□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.15□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC01600Q96MT4 127 aa6.15□□□□□ -1.42
ACTR1A-202ENST00000470322 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.15□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 K7EIL1 84 aa6.13□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 ERC2-IT1O76042 136 aa6.12□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.12□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 H7BZZ5 65 aa6.12□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.12□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 A0A087WSZ3 146 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 REG3GQ6UW15 175 aa6.11□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.1□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.1□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 H0Y9J4 135 aa6.1□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 Q8N377 158 aa6.1□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.09□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 H3BNG1 76 aa6.09□□□□□ -1.43
ACTR1A-202ENST00000470322 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 Q6ZRX8 168 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 H3BQ85 93 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 SMIM29Q86T20 159 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 NDUFS5O43920 106 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 Q9BRP9 147 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 CXCL6P80162 114 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 PRYO14603 147 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 MDFIQ99750 246 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTR1A-202ENST00000470322 A0A1W2PNM2 257 aa6.02□□□□□ -1.45
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