RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	C16orf90	A8MZG2	172 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	COX7C	P15954	63 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	APLN	Q9ULZ1	77 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		7.47	□□□□□ -1.21
TTLL3-222	ENST00000459758	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		7.46	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758		B5MCH6	92 aa		7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	REG3G	Q6UW15	175 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZVQ6	151 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	SERP2	Q8N6R1	65 aa		7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	TENM3	Q9P273	2699 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758		F8WEM9	126 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	HAMP	P81172	84 aa		7.42	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	CCDC179	H3BU77	68 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	CRYGA	P11844	174 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	7.41	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2B	P63146	152 aa		7.4	□□□□□ -1.22
TTLL3-222	ENST00000459758	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758		H0Y9J4	135 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	NREP	Q16612	68 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	CASC10	Q5T4H9	136 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758		Q8N377	158 aa		7.39	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	COL6A5	A8TX70	2615 aa		7.38	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		7.37	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM168B	A1KXE4	195 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758		Q9BRP9	147 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A096LNI7	61 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf137	Q5JT78	98 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	MDFI	Q99750	246 aa		7.35	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A087WVE0	104 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		7.34	□□□□□ -1.23
TTLL3-222	ENST00000459758	NOTCH1	P46531	2555 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	BPY2	O14599	106 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	TNP2	Q05952	138 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758		Q8NBF4	154 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	TMEM258	P61165	79 aa		7.32	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ANK2	Q01484	3957 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		7.3	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758		M0R2N4	97 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	NDUFC1	O43677	76 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.29	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRR1B	P22528	89 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758	UBE2A	P49459	152 aa		7.28	□□□□□ -1.24
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PNN7	141 aa		7.26	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	C3orf84	H3BNL1	204 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A1W2PNM2	257 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	DPH3	Q96FX2	82 aa		7.24	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	EPM2A	B3EWF7	344 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	IGKV4-1	P06312	121 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	KLKP1	Q107X0	134 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SMIM29	Q86T20	159 aa		7.23	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758		A0A087WTM6	91 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758		J3KT08	172 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PRLH	P81277	87 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TTLL3-222	ENST00000459758	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	IGFL1	Q6UW32	110 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	SCX	Q7RTU7	201 aa		7.2	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758		Q6ZR54	194 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	C20orf197	Q8N268	126 aa		7.19	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	CHTF8	P0CG12	524 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		7.18	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	RTL8C	O15255	209 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	COL7A1	Q02388	2944 aa		7.17	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		7.16	□□□□□ -1.26
TTLL3-222	ENST00000459758	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		7.15	□□□□□ -1.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms