RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 BATFQ16520 125 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 RAB37Q96AX2 223 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 A6NDN8 102 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 GAGE10A6NGK3 116 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 LRP2P98164 4655 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GWB2 263 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 K7ERJ3 54 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 LINC01600Q96MT4 127 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 LINC00167Q96N53 147 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 IGLV6-57P01721 117 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 TMEM126AQ9H061 195 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 UBE2BP63146 152 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 RNF213Q63HN8 5207 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 REG3GQ6UW15 175 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-208ENST00000438888 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 H7C2G1 150 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.64□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 PRYO14603 147 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 Q1RN00 199 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.63□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.62□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 TSPAN13O95857 204 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP10-8P60410 259 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.61□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 DIRC1Q969H9 104 aa7.6□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 SPRR1AP35321 89 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 C6orf99Q4VX62 202 aa7.59□□□□□ -1.19
PRAME-208ENST00000438888 PSMB2P49721 201 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.58□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 TAX1BP3O14907 124 aa7.57□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 TRIAP1O43715 76 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 BCE1O60756 84 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 C1orf137Q5JT78 98 aa7.56□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 C9orf118A6NHY6 69 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 COX7BP24311 80 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 VAMP3Q15836 100 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.55□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 B5MCH6 92 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 H3BUT2 72 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 COX6CP09669 75 aa7.54□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 UBE2AP49459 152 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 PRLHP81277 87 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZRX8 168 aa7.53□□□□□ -1.2
PRAME-208ENST00000438888 H0YGX0 51 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.52□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 H0Y9J4 135 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 IGLV7-43P04211 117 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.51□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 LPAP08519 4548 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 A0A1W2PPM0 123 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.5□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 SLC25A20O43772 301 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 ZNF861PO60384 105 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 FABP2P12104 132 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 LINC00575Q6W349 94 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 CLEC2BQ92478 149 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 Q9BRP9 147 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.49□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.48□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.47□□□□□ -1.21
PRAME-208ENST00000438888 hADV29S1A0JD25 119 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 SNCGO76070 127 aa7.46□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 A0A1B0GX51 115 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 LST1O00453 97 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 TCL1BO95988 128 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 ATXN8Q156A1 80 aa7.45□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 ERC2-IT1O76042 136 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.44□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 DNAL4O96015 105 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 TRACP01848 142 aa7.43□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZQY7 126 aa7.41□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 K7EP34 96 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.4□□□□□ -1.22
PRAME-208ENST00000438888 PRR4Q16378 134 aa7.4□□□□□ -1.22
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