RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.13□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 IGLV6-57P01721 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 AKR1D1P51857 326 aa7.13□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 C20orf202A1L168 122 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 ZNF815PA8K554 130 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 DDTP30046 118 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 SPANXCQ9NY87 97 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-204ENST00000403441 B5MCH6 92 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 ATOH7Q8N100 152 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 SPRR4Q96PI1 79 aa7.08□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 C5orf52A6NGY3 159 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 NPC2P61916 151 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.07□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 S100A2P29034 98 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZRX8 168 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 PCP2Q8IVA1 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 S100A6P06703 90 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 S100A12P80511 92 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 LINC00483Q53H64 154 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZVH6 145 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 Q9BRP9 147 aa7.05□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.04□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 IFITM1P13164 125 aa7.03□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.03□□□□□ -1.28
PRAME-204ENST00000403441 ERC2-IT1O76042 136 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.02□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 MUC17Q685J3 4493 aa7.01□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 Q8NBF4 154 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 COPS9Q8WXC6 57 aa7□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.99□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.98□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 SPINK1P00995 79 aa6.97□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRAME-204ENST00000403441 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.96□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 SPRR1BP22528 89 aa6.95□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 DLEU1O43261 78 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 SCGB1D1O95968 90 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 C6orf99Q4VX62 202 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.94□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 COX8AP10176 69 aa6.93□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 COX7BP24311 80 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.92□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.91□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 MOBPQ13875 183 aa6.91□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GWB2 263 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A20O43772 301 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.9□□□□□ -1.3
PRAME-204ENST00000403441 A4D1N5 150 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 A6NDN8 102 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 Q8N377 158 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.89□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 HIGD1BQ9P298 99 aa6.88□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.87□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 SPATA45Q537H7 98 aa6.87□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 XP32Q5T750 250 aa6.86□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.86□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.86□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 C14orf144Q96I85 54 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 VAMP8Q9BV40 100 aa6.85□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 PYY3Q5JQD4 70 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 SMIM29Q86T20 159 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H4GQ99525 98 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.84□□□□□ -1.31
PRAME-204ENST00000403441 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.83□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.83□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PRAME-204ENST00000403441 CFC1BP0CG36 223 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms