RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 LINC00313P59037 77 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PNM2 257 aa6.47□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.46□□□□□ -1.37
HERC3-202ENST00000402738 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 COL4A2P08572 1712 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 CHTF8P0CG12 524 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.46□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 PCSK5Q92824 1860 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 DNAH12Q6ZR08 3092 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 C16orf90A8MZG2 172 aa6.45□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 H3BNG1 76 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 Q8NAQ8 132 aa6.44□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 FAM229AH3BQW9 127 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 NUPR2A6NF83 97 aa6.43□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 H3BS24 57 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 A0A0C4DFX4 3053 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 ACANP16112 2415 aa6.42□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 FAM104AQ969W3 186 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 A0A096LNT2 108 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 C15orf56Q8N910 161 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 PRR34Q9NV39 138 aa6.41□□□□□ -1.38
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GVX0 72 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.39□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 PRAC1Q96KF2 57 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 Q75L30 129 aa6.38□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 DSCR10P59022 87 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 Q96NJ1 140 aa6.37□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 LINC01554Q52M75 96 aa6.36□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 BPTFQ12830 3046 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 CRIPTQ9P021 101 aa6.35□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 Q5VV11 94 aa6.34□□□□□ -1.39
HERC3-202ENST00000402738 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.33□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 CR1P17927 2039 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 APLNQ9ULZ1 77 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 LAMA3Q16787 3333 aa6.3□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 RTL8CO15255 209 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.29□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 SPRR4Q96PI1 79 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.28□□□□□ -1.4
HERC3-202ENST00000402738 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 USP24Q9UPU5 2620 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 Q8NDZ9 215 aa6.27□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 BRCA2P51587 3418 aa6.26□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 SPINK7P58062 85 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 CASC10Q5T4H9 136 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 Q8N1X5 172 aa6.25□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 LUZP6Q538Z0 58 aa6.24□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 HTTP42858 3142 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 CSAG1Q6PB30 78 aa6.23□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 A0A0D9SG42 100 aa6.22□□□□□ -1.41
HERC3-202ENST00000402738 ZNF861PO60384 105 aa6.21□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 HRES1P13985 223 aa6.2□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 CFAP54Q96N23 3096 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.19□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.17□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 C5orf42Q9H799 3197 aa6.17□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 C9orf92A6NGG3 77 aa6.15□□□□□ -1.42
HERC3-202ENST00000402738 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.14□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GU33 70 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-3P60369 221 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-11P60412 298 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.11□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.1□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 IGLV7-43P04211 117 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 AKAP13Q12802 2813 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.09□□□□□ -1.43
HERC3-202ENST00000402738 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 CDH23Q9H251 3354 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 A0A0A0MQY5 61 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 SPRR1AP35321 89 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 A0A087WTM6 91 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 TRANK1O15050 2925 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 A6NN06 94 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.03□□□□□ -1.44
HERC3-202ENST00000402738 K7EIL1 84 aa6.02□□□□□ -1.45
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