RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 MRAPQ8TCY5 172 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.55□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 UPK3BQ9BT76 320 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZVQ6 151 aa8.53□□□□□ -1.04
PRAME-203ENST00000402697 A0A1B0GW54 56 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 A0A087WVE0 104 aa8.52□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 PRYO14603 147 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.51□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 COL7A1Q02388 2944 aa8.5□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 C7orf33Q8WU49 177 aa8.49□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.48□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 SPRR1AP35321 89 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 HAMPP81172 84 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 TMEM258P61165 79 aa8.47□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.46□□□□□ -1.05
PRAME-203ENST00000402697 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 Q6ZRX8 168 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 M0R2N4 97 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 Q8N377 158 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 J3KT08 172 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAME-203ENST00000402697 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.073e-10■□□□□ 9.6
PRAME-203ENST00000402697 NREPQ16612 68 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 C14orf177Q52M58 125 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 B9D2Q9BPU9 175 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 DNHD1Q96M86 4753 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 TNP2Q05952 138 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 Q9BRP9 147 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 CASC10Q5T4H9 136 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 ERC2-IT1O76042 136 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 REG3GQ6UW15 175 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 C16orf90A8MZG2 172 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 KLKP1Q107X0 134 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 FAM168BA1KXE4 195 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 BPY2O14599 106 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-203ENST00000402697 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 NDUFC1O43677 76 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 Q8NBF4 154 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 SPRR4Q96PI1 79 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 C1orf137Q5JT78 98 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 C20orf197Q8N268 126 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 DPH3Q96FX2 82 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 UBE2BP63146 152 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 IGKV4-1P06312 121 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 PSCAO43653 123 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 LYSTQ99698 3801 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 F8WEM9 126 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 APLNQ9ULZ1 77 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PNM2 257 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 SCXQ7RTU7 201 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-203ENST00000402697 H0Y9J4 135 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 C3orf84H3BNL1 204 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 A0A096LNI7 61 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 H7BZZ5 65 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 FAM236CP0DP71 79 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 TENM2Q9NT68 2774 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 SMIM29Q86T20 159 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 OCR1Q9BZK8 76 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 NUPR2A6NF83 97 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-203ENST00000402697 A0A1W2PNN7 141 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 SPRR1BP22528 89 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.19□□□□□ -1.1
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