RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.83□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM168BA1KXE4 195 aa10.83□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 ITPR3Q14573 2671 aa10.83□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 CDH23Q9H251 3354 aa10.82□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 Q8N377 158 aa10.82□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.8□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-3P60369 221 aa10.79□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 MOBPQ13875 183 aa10.78□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa10.78□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.77□□□□□ -0.68
CTDSP2-201ENST00000398073 MDFIQ99750 246 aa10.77□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 A8MWP4 228 aa10.76□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 ATRQ13535 2644 aa10.75□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 TLX1NBP0CAT3 122 aa10.75□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa10.75□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 DSPP15924 2871 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.74□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 CHTF8P0CG12 524 aa10.73□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 IGFL1Q6UW32 110 aa10.73□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 FRYQ5TBA9 3013 aa10.71□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 MGAM2Q2M2H8 2515 aa10.71□□□□□ -0.69
CTDSP2-201ENST00000398073 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa10.7□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 LAMA1P25391 3075 aa10.7□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.69□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.69□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 ACYP2P14621 99 aa10.68□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.68□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 CFAP46Q8IYW2 2715 aa10.68□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PNM2 257 aa10.68□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 KRTAP10-11P60412 298 aa10.67□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 PRR15Q8IV56 129 aa10.67□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.67□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 AKAP13Q12802 2813 aa10.67□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.66□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
CTDSP2-201ENST00000398073 A8MUN3 132 aa10.64□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 IGKV2-30P06310 120 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 SPINK1P00995 79 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 CHD6Q8TD26 2715 aa10.63□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GU69 56 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 VCANP13611 3396 aa10.62□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 RTL8CO15255 209 aa10.61□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 COA5Q86WW8 74 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.6□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A0G2JQZ4 141 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1W2PNN7 141 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 OCR1Q9BZK8 76 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 DNAH14Q0VDD8 3507 aa10.59□□□□□ -0.71
CTDSP2-201ENST00000398073 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SZT2Q5T011 3432 aa10.58□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 LINC00313P59037 77 aa10.56□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 CASC10Q5T4H9 136 aa10.55□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.55□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 MAST4O15021 2626 aa10.55□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.55□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.54□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 K7EIL1 84 aa10.54□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.54□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 Q8NDZ9 215 aa10.54□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 C8orf87E5RJ46 101 aa10.53□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.72
CTDSP2-201ENST00000398073 CR1P17927 2039 aa10.52□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM229AH3BQW9 127 aa10.51□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRR4Q96PI1 79 aa10.5□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.5□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A1B0GVX0 72 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.49□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 DSCR10P59022 87 aa10.47□□□□□ -0.73
CTDSP2-201ENST00000398073 WIPF1O43516 503 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF861PO60384 105 aa10.45□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 FREM2Q5SZK8 3169 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 KALRNO60229 2985 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.43□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 UNC79Q9P2D8 2635 aa10.42□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.41□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 FRYLO94915 3013 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa10.4□□□□□ -0.74
CTDSP2-201ENST00000398073 Q5XG85 94 aa10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.39□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 A0A087WTM6 91 aa10.38□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 SPRR1AP35321 89 aa10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 Q1T7F1 81 aa10.37□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.35□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 APLNQ9ULZ1 77 aa10.35□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 TEX15Q9BXT5 2789 aa10.35□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.34□□□□□ -0.75
CTDSP2-201ENST00000398073 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 UQCR11O14957 56 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 Q96NJ1 140 aa10.33□□□□□ -0.76
CTDSP2-201ENST00000398073 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms