RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 ITPR3Q14573 2671 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 Q96NJ1 140 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 ERC2-IT1O76042 136 aa13.36□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP10-3P60369 221 aa13.35□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 CENPEQ02224 2701 aa13.34□□□□□ -0.27
CCSAP-203ENST00000366687 IGFL1Q6UW32 110 aa13.33□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.32□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa13.31□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N377 158 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF861PO60384 105 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 CEP350Q5VT06 3117 aa13.3□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 C4orf26Q17RF5 130 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.29□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 PRR15Q8IV56 129 aa13.28□□□□□ -0.28
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WTM6 91 aa13.26□□□□□ -0.29
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP46Q8IYW2 2715 aa13.25□□□□□ -0.29
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-203ENST00000366687 C8orf17Q9NRJ1 99 aa13.23□□□□□ -0.29
CCSAP-203ENST00000366687 STAB1Q9NY15 2570 aa13.22□□□□□ -0.29
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-203ENST00000366687 KLKP1Q107X0 134 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GVX0 72 aa13.18□□□□□ -0.3
CCSAP-203ENST00000366687 KRTAP1-1Q07627 177 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-203ENST00000366687 COA5Q86WW8 74 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00304Q8N9R0 145 aa13.17□□□□□ -0.3
CCSAP-203ENST00000366687 DSCR10P59022 87 aa13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01600Q96MT4 127 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 AKAP13Q12802 2813 aa13.13□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PNN7 141 aa13.12□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0G2JQZ4 141 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 APLNQ9ULZ1 77 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 J3QL48 77 aa13.11□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 CASC10Q5T4H9 136 aa13.1□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 A8MUN3 132 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV7-43P04211 117 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF575Q86XF7 245 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa13.09□□□□□ -0.31
CCSAP-203ENST00000366687 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PNM2 257 aa13.07□□□□□ -0.32
CCSAP-203ENST00000366687 UQCR11O14957 56 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-203ENST00000366687 SPRR4Q96PI1 79 aa13.06□□□□□ -0.32
CCSAP-203ENST00000366687 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.05□□□□□ -0.32
CCSAP-203ENST00000366687 CHD7Q9P2D1 2997 aa13.03□□□□□ -0.32
CCSAP-203ENST00000366687 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa13.01□□□□□ -0.33
CCSAP-203ENST00000366687 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-203ENST00000366687 H7BZZ5 65 aa13□□□□□ -0.33
CCSAP-203ENST00000366687 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CCSAP-203ENST00000366687 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CCSAP-203ENST00000366687 C9orf92A6NGG3 77 aa12.96□□□□□ -0.34
CCSAP-203ENST00000366687 COX6B2Q6YFQ2 88 aa12.95□□□□□ -0.34
CCSAP-203ENST00000366687 CHD6Q8TD26 2715 aa12.94□□□□□ -0.34
CCSAP-203ENST00000366687 UTRNP46939 3433 aa12.91□□□□□ -0.34
CCSAP-203ENST00000366687 TEX15Q9BXT5 2789 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-203ENST00000366687 CR1P17927 2039 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-203ENST00000366687 MIR22HGQ0VDD5 57 aa12.88□□□□□ -0.35
CCSAP-203ENST00000366687 WIPF1O43516 503 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-203ENST00000366687 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa12.86□□□□□ -0.35
CCSAP-203ENST00000366687 FAM104AQ969W3 186 aa12.84□□□□□ -0.35
CCSAP-203ENST00000366687 COL6A5A8TX70 2615 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-203ENST00000366687 C5orf42Q9H799 3197 aa12.82□□□□□ -0.36
CCSAP-203ENST00000366687 CHD9Q3L8U1 2897 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-203ENST00000366687 TNP2Q05952 138 aa12.8□□□□□ -0.36
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF292O60281 2723 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-203ENST00000366687 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-203ENST00000366687 SPINT4Q6UDR6 99 aa12.79□□□□□ -0.36
CCSAP-203ENST00000366687 CD164Q04900 197 aa12.77□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 NOTCH1P46531 2555 aa12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 CRIPTQ9P021 101 aa12.75□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 OCR1Q9BZK8 76 aa12.74□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 PCNTO95613 3336 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 MGAQ8IWI9 3026 aa12.71□□□□□ -0.37
CCSAP-203ENST00000366687 Q8N1X5 172 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-203ENST00000366687 UNC79Q9P2D8 2635 aa12.7□□□□□ -0.38
CCSAP-203ENST00000366687 CFAP54Q96N23 3096 aa12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-203ENST00000366687 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
CCSAP-203ENST00000366687 FAM229BQ4G0N7 80 aa12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-203ENST00000366687 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
CCSAP-203ENST00000366687 SPRR1AP35321 89 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-203ENST00000366687 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.61□□□□□ -0.39
CCSAP-203ENST00000366687 PLAC8Q9NZF1 115 aa12.57□□□□□ -0.4
CCSAP-203ENST00000366687 Q8NDZ9 215 aa12.56□□□□□ -0.4
CCSAP-203ENST00000366687 HTTP42858 3142 aa12.55□□□□□ -0.4
CCSAP-203ENST00000366687 LINC01554Q52M75 96 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-203ENST00000366687 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-203ENST00000366687 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-203ENST00000366687 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CCSAP-203ENST00000366687 A0A0C4DFX4 3053 aa12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms