RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362076.8

C1orf43-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf43, Length 1,551 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-202ENST00000362076 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
C1orf43-202ENST00000362076 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa10.21□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 SDIM1Q6ZPB5 146 aa10.21□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.21□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.2□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.2□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.18□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 INAFM2P0DMQ5 153 aa10.18□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 LINC00528Q8N1L1 170 aa10.18□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 RPL37AP8A6NKH3 93 aa10.17□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 SPRR1AP35321 89 aa10.17□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.16□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 A0A1W2PNN7 141 aa10.15□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 RTL8CO15255 209 aa10.15□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 KMT2AQ03164 3969 aa10.15□□□□□ -0.78
C1orf43-202ENST00000362076 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa10.14□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.14□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 CHTF8P0CG12 524 aa10.13□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 REG3GQ6UW15 175 aa10.13□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 Q6ZQY7 126 aa10.13□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.12□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 Q6ZRX8 168 aa10.12□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.12□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 VPS25Q9BRG1 176 aa10.12□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa10.11□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 B5MCH6 92 aa10.11□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.1□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 DPH3Q96FX2 82 aa10.1□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 EPM2AB3EWF7 344 aa10.09□□□□□ -0.79
C1orf43-202ENST00000362076 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa10.08□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 TNP2Q05952 138 aa10.08□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 UBE2BP63146 152 aa10.07□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 ACYP1P07311 99 aa10.06□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.05□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 DNAH2Q9P225 4427 aa10.04□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 PANO1I0J062 215 aa10.03□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 Q9BRP9 147 aa10.03□□□□□ -0.8
C1orf43-202ENST00000362076 H0Y9J4 135 aa10.02□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa10.02□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.02□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.01□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.01□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa10.01□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 PDE6GP18545 87 aa10.01□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 LCE6AA0A183 80 aa10□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 CDIP1Q9H305 208 aa9.99□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.98□□□□□ -0.818e-10■■■■■ 28.6
C1orf43-202ENST00000362076 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.98□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.97□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.97□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.97□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 DSCR8Q96T75 97 aa9.97□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 BCE1O60756 84 aa9.97□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 CCKP06307 115 aa9.97□□□□□ -0.81
C1orf43-202ENST00000362076 Q8N377 158 aa9.96□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 SIGMAR1Q99720 223 aa9.96□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 UBE2AP49459 152 aa9.95□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 KRTAP10-2P60368 255 aa9.95□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.95□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 PRLHP81277 87 aa9.94□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.94□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.94□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.94□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 A0A1B0GV72 72 aa9.93□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 ERC2-IT1O76042 136 aa9.93□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 Q6ZQT0 140 aa9.92□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.92□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.91□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.91□□□□□ -0.82
C1orf43-202ENST00000362076 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.88□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 XGP55808 180 aa9.88□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 Q6ZSA8 131 aa9.88□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 LINC00643Q86TS7 51 aa9.87□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.86□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 F8WEM9 126 aa9.85□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 SPRR1BP22528 89 aa9.85□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.84□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 MT-ATP8P03928 68 aa9.84□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 KRTAP10-1P60331 282 aa9.84□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.84□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 LINC00846Q9NV44 126 aa9.84□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.84□□□□□ -0.83
C1orf43-202ENST00000362076 A0A1B0GW54 56 aa9.83□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 C1orf137Q5JT78 98 aa9.83□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.82□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 SMIM29Q86T20 159 aa9.82□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.81□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF861PO60384 105 aa9.81□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.81□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 UBL5Q9BZL1 73 aa9.81□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
C1orf43-202ENST00000362076 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms