RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308580.11

TMOD3-201, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD3, Length 8,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-201ENST00000308580 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.58□□□□□ -1.36
TMOD3-201ENST00000308580 IGKV2-30P06310 120 aa6.58□□□□□ -1.36
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TMOD3-201ENST00000308580 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.57□□□□□ -1.36
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TMOD3-201ENST00000308580 C15orf56Q8N910 161 aa6.57□□□□□ -1.36
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TMOD3-201ENST00000308580 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.55□□□□□ -1.36
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TMOD3-201ENST00000308580 A0A1W2PNN7 141 aa6.48□□□□□ -1.37
TMOD3-201ENST00000308580 H3BPC8 53 aa6.48□□□□□ -1.37
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TMOD3-201ENST00000308580 C4orf26Q17RF5 130 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-201ENST00000308580 A8MWP4 228 aa6.47□□□□□ -1.37
TMOD3-201ENST00000308580 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.47□□□□□ -1.37
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TMOD3-201ENST00000308580 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.45□□□□□ -1.38
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TMOD3-201ENST00000308580 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.45□□□□□ -1.38
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TMOD3-201ENST00000308580 ACYP2P14621 99 aa6.45□□□□□ -1.38
TMOD3-201ENST00000308580 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.44□□□□□ -1.38
TMOD3-201ENST00000308580 FAM104AQ969W3 186 aa6.44□□□□□ -1.38
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TMOD3-201ENST00000308580 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-201ENST00000308580 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-201ENST00000308580 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
TMOD3-201ENST00000308580 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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TMOD3-201ENST00000308580 Q96NJ1 140 aa6.4□□□□□ -1.39
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TMOD3-201ENST00000308580 A0A1W2PNM2 257 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-201ENST00000308580 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.39□□□□□ -1.39
TMOD3-201ENST00000308580 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.39□□□□□ -1.39
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TMOD3-201ENST00000308580 C8orf87E5RJ46 101 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-201ENST00000308580 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.38□□□□□ -1.39
TMOD3-201ENST00000308580 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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TMOD3-201ENST00000308580 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.36□□□□□ -1.39
TMOD3-201ENST00000308580 DSCR10P59022 87 aa6.36□□□□□ -1.39
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TMOD3-201ENST00000308580 CDH23Q9H251 3354 aa6.34□□□□□ -1.39
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TMOD3-201ENST00000308580 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.33□□□□□ -1.4
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TMOD3-201ENST00000308580 LINC01600Q96MT4 127 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-201ENST00000308580 IGLV7-43P04211 117 aa6.32□□□□□ -1.4
TMOD3-201ENST00000308580 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.32□□□□□ -1.4
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TMOD3-201ENST00000308580 WIPF1O43516 503 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-201ENST00000308580 FLNCQ14315 2725 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-201ENST00000308580 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.3□□□□□ -1.4
TMOD3-201ENST00000308580 Q8NDZ9 215 aa6.28□□□□□ -1.4
TMOD3-201ENST00000308580 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-201ENST00000308580 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.26□□□□□ -1.41
TMOD3-201ENST00000308580 C9orf92A6NGG3 77 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-201ENST00000308580 TACC2O95359 2948 aa6.25□□□□□ -1.41
TMOD3-201ENST00000308580 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.24□□□□□ -1.41
TMOD3-201ENST00000308580 TNP2Q05952 138 aa6.24□□□□□ -1.41
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