RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.8□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MWP4 228 aa7.8□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 TNP2Q05952 138 aa7.79□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.79□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV7-43P04211 117 aa7.78□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 MTORP42345 2549 aa7.78□□□□□ -1.16
UBASH3B-201ENST00000284273 C19orf73Q9NVV2 129 aa7.77□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.75□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 C8orf87E5RJ46 101 aa7.75□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 Q6ZSA8 131 aa7.75□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 BPTFQ12830 3046 aa7.74□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 COA5Q86WW8 74 aa7.74□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 PCNTO95613 3336 aa7.74□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.74□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 CRIPTQ9P021 101 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.73□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 CEP350Q5VT06 3117 aa7.72□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 CEP295Q9C0D2 2601 aa7.72□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.71□□□□□ -1.17
UBASH3B-201ENST00000284273 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.7□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC01546A6NGU7 62 aa7.7□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 ERC2-IT1O76042 136 aa7.7□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GVX0 72 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.69□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8N377 158 aa7.68□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 PRR15Q8IV56 129 aa7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 A8MUN3 132 aa7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.67□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.66□□□□□ -1.18
UBASH3B-201ENST00000284273 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.64□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 USP24Q9UPU5 2620 aa7.63□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa7.63□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A096LNT2 108 aa7.62□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRR4Q96PI1 79 aa7.61□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 LITAFQ99732 161 aa7.61□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 UQCR11O14957 56 aa7.61□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BPC8 53 aa7.6□□□□□ -1.19
UBASH3B-201ENST00000284273 PRR34Q9NV39 138 aa7.57□□□□□ -1.2
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-201ENST00000284273 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.56□□□□□ -1.2
UBASH3B-201ENST00000284273 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.54□□□□□ -1.2
UBASH3B-201ENST00000284273 CR1P17927 2039 aa7.54□□□□□ -1.2
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GW54 56 aa7.54□□□□□ -1.2
UBASH3B-201ENST00000284273 PRO0461Q9UI25 63 aa7.53□□□□□ -1.2
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM104AQ969W3 186 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 Q5VSD8 79 aa7.52□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 PRO0628Q9UI54 55 aa7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1W2PNM2 257 aa7.45□□□□□ -1.22
UBASH3B-201ENST00000284273 S4R3F8 94 aa7.43□□□□□ -1.22
UBASH3B-201ENST00000284273 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
UBASH3B-201ENST00000284273 WIPF1O43516 503 aa7.42□□□□□ -1.22
UBASH3B-201ENST00000284273 EPG5Q9HCE0 2579 aa7.41□□□□□ -1.22
UBASH3B-201ENST00000284273 BRCA2P51587 3418 aa7.41□□□□□ -1.22
UBASH3B-201ENST00000284273 CFAP54Q96N23 3096 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 LUZP6Q538Z0 58 aa7.37□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 CD164Q04900 197 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 LINC00483Q53H64 154 aa7.36□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-2P60368 255 aa7.35□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BS24 57 aa7.34□□□□□ -1.23
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMA3Q16787 3333 aa7.33□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP10-1P60331 282 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 KLK9Q2XQG4 91 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 HRES1P13985 223 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.32□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 CSAG1Q6PB30 78 aa7.31□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A1B0GU33 70 aa7.3□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 R4GN34 69 aa7.3□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.29□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 ATRQ13535 2644 aa7.28□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
UBASH3B-201ENST00000284273 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 ITPR3Q14573 2671 aa7.27□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 LCE6AA0A183 80 aa7.27□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.25□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 SPINK7P58062 85 aa7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 H7BZZ5 65 aa7.24□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 Q1T7F1 81 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A0C4DFX4 3053 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-201ENST00000284273 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.7 ms